RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 MTMR14Q8NCE2 650 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 UTYO14607 1347 aa26.57■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC85CA6NKD9 419 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 UBE4AQ14139 1066 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 CERS5Q8N5B7 392 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 PTPRCP08575 1304 aa26.56■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 KAZALD1Q96I82 304 aa26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1B0GUL6 1792 aa26.55■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 DGKZQ13574 1117 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.54■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 F8W031 263 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 MYO1BO43795 1136 aa26.53■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 SLFN5Q08AF3 891 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 CFAP100Q494V2 611 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.52■■□□□ 1.84
NEDD8-201ENST00000250495 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.51■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 JAG2Q9Y219 1238 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa26.5■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 PRKG1Q13976 671 aa26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 SPDYE2BA6NHP3 402 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 SPDYE6P0CI01 402 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 GYG1P46976 350 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 TM4SF4P48230 202 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 MFSD14BQ5SR56 506 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.47■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 VPS37DQ86XT2 251 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 USP44Q9H0E7 712 aa26.46■■□□□ 1.83
NEDD8-201ENST00000250495 CLRN2A0PK11 232 aa26.45■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 METTL24Q5JXM2 366 aa26.45■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 VEZTQ9HBM0 779 aa26.45■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 SREBF2Q12772 1141 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 MAP3K11Q16584 847 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC24Q50LG9 513 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 PDE8BO95263 885 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 RGS19P49795 217 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.43■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 UNCXA6NJT0 531 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.42■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 TNFAIP1Q13829 316 aa26.41■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 SPRYD7Q5W111 196 aa26.41■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D8O95759 1140 aa26.4■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 RASA3Q14644 834 aa26.4■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.4■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 FZD1Q9UP38 647 aa26.4■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 INHBEP58166 350 aa26.39■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.39■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.39■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NEDD8-201ENST00000250495 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 SPDYE2Q495Y8 402 aa26.38■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 AOX1Q06278 1338 aa26.38■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 CRKP46108 304 aa26.37■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 ALDH1A1P00352 501 aa26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
NEDD8-201ENST00000250495 CCER2I3L3R5 266 aa26.35■■□□□ 1.81
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