RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038889.11

Ttll3-202, Transcript of Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Ttll3, Length 3,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Itga6Q61739 1091 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ankle2Q6P1H6 964 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Slc5a1Q8C3K6 665 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tmc2Q8R4P4 888 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Mei1Q9D4I2 1268 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Jakmip2D3YXK0 820 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ess2O70279 479 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Mkrn3Q60764 544 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Zmynd15Q8C0R7 736 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Alg3Q8K2A8 438 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Trim59Q922Y2 403 aa17.73■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gm29094F6Q785 221 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Amigo3Q8C2S7 508 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 MthfsQ9D110 203 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Syde2E9PUP1 1314 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Slc1a4O35874 532 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ddx58Q6Q899 926 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Kcnq3Q8K3F6 873 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Kmt5bQ3U8K7 883 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gnat3Q3V3I2 354 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Drc7Q6V3W6 876 aa17.72■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Kif2aP28740 705 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Arl8aQ8VEH3 186 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Abcb6Q9DC29 842 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ank1Q02357 1862 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Naa16Q9DBB4 864 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Large1Q9Z1M7 756 aa17.71■□□□□ 0.43
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Diaph1O08808 1255 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 LtkP08923 888 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Sult6b1P0CC03 303 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Flad1Q8R123 492 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Vmn2r23E9PXI5 849 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cplx1P63040 134 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Pfkfb1P70266 471 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fez2Q6TYB5 348 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 CtcfQ61164 736 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Trak2Q6P9N8 913 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cdc45Q9Z1X9 566 aa17.7■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Bcl9lQ67FY2 1494 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Zfp597E9Q6S0 419 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 CebpaP53566 359 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Acnat2Q8BGG9 420 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Trim52Q8CDV4 233 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Txnrd1Q9JMH6 613 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Rtel1Q0VGM9 1203 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Lrrc2Q8VDB8 371 aa17.69■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Rgs12Q8CGE9 1381 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Spata32Q8C5V0 334 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Atad2Q8CDM1 1040 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ints5Q8CHT3 1018 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fam76aQ922G2 307 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Acsbg1Q99PU5 721 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Grin2dQ03391 1323 aa17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Larp6Q8BN59 492 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ncaph2Q8BSP2 607 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Etf1Q8BWY3 437 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Rapgef3Q8VCC8 918 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Ric1Q69ZJ7 1422 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 GmnnO88513 206 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cep55Q8BT07 462 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tmem87aQ8BXN9 555 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Krt25Q8VCW2 446 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 NefhP19246 1090 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Igflr1Q3U4N7 345 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cdc37Q61081 379 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Cep120Q7TSG1 988 aa17.67■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Map7d2A2AG50 781 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Maats1Q8BRC6 783 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Col22a1E9Q7P1 1613 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 H2afxP27661 143 aaKnown RBP17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Bag1Q60739 355 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Atg9aQ68FE2 551 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fam53cQ8BXQ8 393 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 BccipQ9CWI3 316 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Lonp2Q9DBN5 852 aa17.66■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fbxl16A2RT62 479 aa17.65■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 BcanQ61361 883 aa17.65■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 Fsd2Q8BZ52 692 aa17.65■□□□□ 0.42
Ttll3-202ENSMUST00000038889 ChmQ9QXG2 665 aa17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.7 ms