RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568631.5

RNPS1-223, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-223	ENST00000568631	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	OVOL3	O00110	214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF205	O95201	554 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DTYMK	P23919	212 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	COL8A2	P25067	703 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	GABRA2	P47869	451 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ASAH1	Q13510	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	RGS21	Q2M5E4	152 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	STUM	Q69YW2	141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	POC5	Q8NA72	575 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	CCL19	Q99731	98 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	CHST6	Q9GZX3	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF222	Q9UK12	451 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	FLNC	Q14315	2725 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	PSPN	O60542	156 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DAO	P14920	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	COL8A1	P27658	744 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	KCNJ3	P48549	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	TAS2R19	P59542	299 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF561	Q8N587	486 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DYRK2	Q92630	601 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	CENPX	A8MT69	81 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631		H7C1Q1	480 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	PLA2G10	O15496	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	RP2	O75695	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	FSTL3	O95633	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	EFNA4	P52798	201 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	SDSL	Q96GA7	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	SNX22	Q96L94	193 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	PPA2	Q9H2U2	334 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	EDAR	Q9UNE0	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	LYRM1	O43325	122 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	GYPA	P02724	150 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	TFF1	P04155	84 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	FCGR3A	P08637	254 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	LYNX1	P0DP58	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	NAT1	P18440	290 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	SSTR2	P30874	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	BTG1	P62324	171 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM165	Q9HC07	324 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		13.52	□□□□□ -0.24
RNPS1-223	ENST00000568631	TMEM82	A0PJX8	343 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	NDUFA2	O43678	99 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF737	O75373	536 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	NAPSA	O96009	420 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	CSN2	P05814	226 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	FCER2	P06734	321 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	LY6H	O94772	140 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	TBP	P20226	339 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	OR3A1	P47881	315 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	GRK1	Q15835	563 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-223	ENST00000568631	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms