RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 NLRC3Q7RTR2 1065 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 OR8H2Q8N162 312 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF525Q8N782 197 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 PERPQ96FX8 193 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 GAFA1Q96PS6 74 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 PECRQ9BY49 303 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 SHARPINQ9H0F6 387 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 IL36RNQ9UBH0 155 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 MGAT4AQ9UM21 535 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.06□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 CEACAM18A8MTB9 384 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 HLA-DQB1P01920 261 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 GYPAP02724 150 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 TK1P04183 234 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 DTYMKP23919 212 aa10.05□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 TAS2R20P59543 309 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 COL10A1Q03692 680 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 MOGAT2Q3SYC2 334 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 CDNFQ49AH0 187 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 LRRC10Q5BKY1 277 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 SLC35E4Q6ICL7 350 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 C17orf107Q6ZR85 190 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF554Q86TJ5 538 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 GDPD1Q8N9F7 314 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 SUMF2Q8NBJ7 301 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 SEH1LQ96EE3 360 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 CHST6Q9GZX3 395 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 AKIP1Q9NQ31 210 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 OR14J1Q9UGF5 321 aa10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 KCNK7Q9Y2U2 307 aa10.05□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 TRAV18A0A075B6X5 111 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 TMEM82A0PJX8 343 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 TMPRSS2O15393 492 aa10.04□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 PSPNO60542 156 aa10.04□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 CR1LQ2VPA4 569 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ATAD3CQ5T2N8 411 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 Q6ZS49 121 aa10.04□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 DEFB108BQ8NET1 73 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 OR8B3Q8NGG8 313 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 DEDD2Q8WXF8 326 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 RAB39BQ96DA2 213 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 OR8B2Q96RD0 313 aa10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ISPDA4D126 451 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 A8MXK9 166 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 GABARAPH6UMI1 98 aa10.03□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 ADAM20O43506 726 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 NDUFB3O43676 98 aa10.03□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 PRSS3P35030 304 aa10.03□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 ZNF841Q6ZN19 808 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF497Q6ZNH5 498 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 BATF2Q8N1L9 274 aa10.03□□□□□ -0.8
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HDLBP-215ENST00000427487 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 GPX8Q8TED1 209 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.03□□□□□ -0.8
HDLBP-215ENST00000427487 ABHD1Q96SE0 405 aa10.03□□□□□ -0.8
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