RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GSS	P48637	474 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGDIB	P52566	201 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB25	P57735	213 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	IL18R1	Q13478	541 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	GLYAT	Q6IB77	296 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN8	Q6JVE9	175 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SHF	Q7M4L6	423 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	BATF2	Q8N1L9	274 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC7	Q8TAX7	377 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP3	Q92482	292 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LYZL4	Q96KX0	146 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	FUZ	Q9BT04	418 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	8.63	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB11	A5LHX3	300 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RAMP3	O60896	148 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CD24	P25063	80 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RRM2	P31350	389 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	BRS3	P32247	399 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OPRL1	P41146	370 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTA2	P62736	377 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTG2	P63267	376 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTC1	P68032	377 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTA1	P68133	377 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CASC10	Q5T4H9	136 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	POC1A	Q8NBT0	407 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8NFD4	153 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	THEM6	Q8WUY1	208 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF714	Q96N38	554 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	8.62	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YHG0	523 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RBP4	P02753	201 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP3	P05413	133 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LYN	P07948	512 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PGA5	P0DJD9	388 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF3	P17036	446 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR1D	P28221	377 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	HAAO	P46952	286 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	THBS3	P49746	956 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-2	P60368	255 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	EDDM3A	Q14507	147 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OSR2	Q8N2R0	312 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T33	Q8NG76	320 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PYURF	Q96I23	114 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	AMELY	Q99218	206 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPAL2	Q9H841	368 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		8.61	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	COX4I1	P13073	169 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MYCNOS	P40205	109 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DLX6	P56179	175 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF329	Q86UD4	541 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF573	Q86YE8	665 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8B4	Q96RC9	309 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR25	Q96S07	402 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MED20	Q9H944	212 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		8.6	□□□□□ -1.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	8.6	□□□□□ -1.03

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