RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 RGS10O43665 173 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ZFPL1O95159 310 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 CDK1P06493 297 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 HSMCR30P0CW71 290 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 TMEM225BP0DP42 221 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 NDUFB7P17568 137 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 RAB3AP20336 220 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 CFHR2P36980 270 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 IKZF1Q13422 519 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 UTS2BQ765I0 119 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 NANPQ8TBE9 248 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 AQP3Q92482 292 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 THRSPQ92748 146 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 C1orf159Q96HA4 380 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 OPALINQ96PE5 141 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 CCL13Q99616 98 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 CHST5Q9GZS9 411 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 OCEL1Q9H607 264 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 NLKQ9UBE8 527 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 OR14J1Q9UGF5 321 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.01□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 PQLC2LA1A4F0 135 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 SRRM5B3KS81 715 aa8□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 LHBP01229 141 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 LIPFP07098 398 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 FAM157CP0CG43 387 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 CELP19835 753 aa8□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 IL13RA1P78552 427 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 CDK5R1Q15078 307 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 UBE2V2Q15819 145 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 LYPD2Q6UXB3 125 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 SLC25A26Q70HW3 274 aa8□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 C11orf53Q8IXP5 236 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 Q8IYB0 196 aa8□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 RAB40AQ8WXH6 277 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 GHSRQ92847 366 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 SMIM19Q96E16 107 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 CEP19Q96LK0 163 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 PKIBQ9C010 78 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 FAM192AQ9GZU8 254 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 DNTTIP1Q9H147 329 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 RASSF4Q9H2L5 321 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa8□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 AUP1Q9Y679 476 aa8□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 A0A1W2PQ09 198 aa7.99□□□□□ -1.13
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PKP4-208ENST00000462335 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 IL24Q13007 206 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 BLMHQ13867 455 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 SPHARQ15513 63 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 YIF1BQ5BJH7 314 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 Q6ZSR3 168 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 KRT74Q7RTS7 529 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.99□□□□□ -1.13
PKP4-208ENST00000462335 BATF2Q8N1L9 274 aa7.99□□□□□ -1.13
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