RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260810.9

TOPBP1-201, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOPBP1, Length 5,378 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-201ENST00000260810 ECI1P42126 302 aa4.76□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 MTNR1AP48039 350 aa4.76□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 EXT1Q16394 746 aa4.76□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 GRINAQ7Z429 371 aa4.76□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 LHFPL5Q8TAF8 219 aa4.76□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 LY86O95711 162 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 HIVEP2P31629 2446 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 NPR2P20594 1047 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 ALDH3B1P43353 468 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 CADM2Q8N3J6 435 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 MPP4Q96JB8 637 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 OR8B4Q96RC9 309 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 RAD52P43351 418 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 ZNF843Q8N446 348 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 ESX1Q8N693 406 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 OR6X1Q8NH79 312 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 HSPB2A8KAH6 182 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 THBS3P49746 956 aa4.75□□□□□ -1.65
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TOPBP1-201ENST00000260810 Q6P435 159 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 P2RY8Q86VZ1 359 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 ASB17Q8WXJ9 295 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 KCTD7Q96MP8 289 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 GAL3ST4Q96RP7 486 aa4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
TOPBP1-201ENST00000260810 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.74□□□□□ -1.65
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