RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	VPS9	P54787	451 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	TOS4	Q06266	489 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	TAH18	Q12181	623 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YRM1	Q12340	786 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	LYP1	P32487	611 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CNS1	P33313	385 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RPC37	P36121	282 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RTT105	P40063	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MGS1	P40151	587 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	EAF6	P47128	113 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MRPL19	P53875	158 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	GTR1	Q00582	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	GAD1	Q04792	585 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YCS4	Q06156	1176 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RTT109	Q07794	436 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MDM12	Q92328	271 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	COQ4	O13525	335 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CMP2	P14747	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	BEM3	P32873	1128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SEG2	P34250	1132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	TFA2	P36145	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	BET3	P36149	193 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CCL1	P37366	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PSY4	P38193	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	VPS41	P38959	992 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SPC72	P39723	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	EMP65	P40085	556 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PCL7	P40186	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	NTA1	P40354	457 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	ALR2	P43553	858 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PFD1	P46988	109 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SEC5	P89102	971 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	BLS1	Q06071	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RKM4	Q12504	494 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	GCR1	P07261	785 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	HNM1	P19807	563 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	REC107	P21651	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	DAL80	P26343	269 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	DPH2	P32461	534 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	NPL6	P32832	435 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	ORC2	P32833	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
KTR2	YKR061W	VBA5	P36172	582 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MCM7	P38132	845 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	ERT1	P38140	529 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RRT14	P40470	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	NEO1	P40527	1151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SAP155	P43612	1002 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	NIT2	P47016	307 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MAL11	P53048	616 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YGL082W	P53155	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	NPY1	P53164	384 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	ADI1	Q03677	179 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	CTI6	Q08923	506 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SFI1	Q12369	946 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	RMP1	Q12530	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	LYS2	P07702	1392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MER1	P16523	270 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SAN1	P22470	610 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	SPC29	P33419	253 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YEL1	P34225	687 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	FTH1	P38310	465 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	YHR131C	P38835	850 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	MEF2	P39677	819 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KTR2	YKR061W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.1 ms