RNA–Protein interactions for RNA: YGR058W

PEF1, Transcript of Penta-EF-hand protein, yeast

Gene PEF1, Length 1,008 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEF1	YGR058W	EMP70	P32802	667 aa		5	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	AIM14	P53109	570 aa		5	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	YTA7	P40340	1379 aa		5	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	KOG1	P38873	1557 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	HSL1	P34244	1518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	MDM10	P18409	493 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	PHO11	P35842	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	PHO12	P38693	467 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	YJL206C	P39529	758 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	GID8	P40208	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	NDC80	P40460	691 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	FHN1	P53279	174 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	ATG33	Q06485	197 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	MLH3	Q12083	715 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	TAF3	Q12297	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	YNL195C	P40168	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	REC102	Q02721	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	OSW7	P43611	510 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	ECM3	Q99252	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PEF1	YGR058W	SFL1	P20134	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	DMC1	P25453	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	MNN4	P36044	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	ARG2	P40360	574 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	COX18	P53239	316 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	COG8	Q04632	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	PEX1	P24004	1043 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	YEL1	P34225	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	ADY2	P25613	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	APN2	P38207	520 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	BDH2	P39713	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	YIL166C	P40445	542 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	ATG4	P53867	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	THI22	Q06490	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	USV1	Q12132	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	SSN2	P38931	1420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	SET3	P36124	751 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	GLG1	P36143	616 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	CTR1	P49573	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	TFB2	Q02939	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	DCS2	Q12123	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	BCS1	P32839	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	ARO10	Q06408	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	MET13	P53128	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	IMO32	P53219	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	THI7	Q05998	598 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PEF1	YGR058W	SEC6	P32844	805 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	BIT2	P38346	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	ALG12	P53730	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	FUB1	P25659	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YHR202W	P38887	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YEL020C	P39994	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	RNH70	P53331	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YNL193W	P53870	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	VPS36	Q06696	566 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	SPO11	P23179	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	PIG2	P40187	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	GUD1	Q07729	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	HIR3	P47171	1648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	PRP28	P23394	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	RFX1	P48743	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YGR151C	P53287	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	PPG1	P32838	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YPT7	P32939	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	BEM4	P39011	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	MGS1	P40151	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	RPN13	O13563	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEF1	YGR058W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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