RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L8P0C7I0 530 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP2B4P23634 1241 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSWP56202 376 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PODNQ7Z5L7 613 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L3A6NCW0 530 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L4A6NCW7 530 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MOB2Q70IA6 237 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLFN5Q08AF3 891 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 E9PSI1 815 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP1BP68106 108 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MXD3Q9BW11 206 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MINPP1Q9UNW1 487 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MED23Q9ULK4 1368 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SPEF2Q9C093 1822 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DACT2Q5SW24 774 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 GREM2Q9H772 168 aa30.74■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH3P11055 1940 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF9Q3BBW0 867 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PI4KAP2A4QPH2 592 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX58O95786 925 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 KSR2Q6VAB6 950 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa30.72■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNRD3Q86VQ6 643 aa30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX10P56693 466 aa30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE2Q2LH0YL09 131 aa30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT10BO00744 389 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 IL16Q14005 1332 aa30.67■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 NEURL1BA8MQ27 555 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C1W4 665 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 NEFLP07196 543 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 G2E3Q7L622 706 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 KLRK1P26718 216 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 STRIP1Q5VSL9 837 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HTTP42858 3142 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP7P55210 303 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 COA1Q9GZY4 146 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-216ENST00000628306 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G12BQ9BX93 195 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SASH1O94885 1247 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TM4SF4P48230 202 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 RCAN3Q9UKA8 241 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 LEMD3Q9Y2U8 911 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO3BQ8WXR4 1341 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D8O95759 1140 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 HPS5Q9UPZ3 1129 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 IRS2Q9Y4H2 1338 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CSF1RP07333 972 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 NEXNQ0ZGT2 675 aa30.58■■■□□ 2.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 OGFOD1Q8N543 542 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH16Q9H6N6 1097 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF804BA4D1E1 1349 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA6P23229 1130 aa30.57■■■□□ 2.48
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CAPNS1-216ENST00000628306 FBXW7Q969H0 707 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP14P50281 582 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 LDLRAD1Q5T700 205 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 STK31Q9BXU1 1019 aa30.55■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A2P04920 1241 aa30.54■■■□□ 2.48
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CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0825Q8IV33 1275 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR25O00155 361 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAP23O00161 211 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CFHR5Q9BXR6 569 aa30.54■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GUL6 1792 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2IP78347 998 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CERS5Q8N5B7 392 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD2Q9GZV1 360 aa30.53■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 SSC5DA1L4H1 1573 aa30.52■■■□□ 2.48
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNDQ07001 517 aa30.52■■■□□ 2.48
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