RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 NLGN1Q8N2Q7 840 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 AKAP11Q9UKA4 1901 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 BICDL1Q6ZP65 573 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZBTB7AO95365 584 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.16■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 SCARF1Q14162 830 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 CREB3L3Q68CJ9 461 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 C3orf67Q6ZVT6 689 aa34.14■■■■□ 3.06
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC5A1P13866 664 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 TSGA10IPQ3SY00 556 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 MTFR1LQ9H019 292 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTC14Q96N46 770 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 HMG20BQ9P0W2 317 aa34.13■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 MCAMP43121 646 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF20Q5VTR2 975 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC102BQ68D86 513 aa34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZAP70P43403 619 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 NFIXQ14938 502 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 COL4A1P02462 1669 aa34.11■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC27A2O14975 620 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 NLRP3Q96P20 1036 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHGBP05060 677 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNJ4P48050 445 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CUL4AQ13619 759 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMX3Q96JJ7 454 aa34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1B0GUL6 1792 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 CHRNDQ07001 517 aa34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 MYH7P12883 1935 aa34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 MMP10P09238 476 aa34.07■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 TM4SF1P30408 202 aa34.07■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 PHKA1P46020 1223 aa34.07■■■■□ 3.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 DSCC1Q9BVC3 393 aa34.07■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADCK5Q3MIX3 580 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSMA5P28066 241 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 VPS53Q5VIR6 699 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAST3O60307 1309 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 CASTP20810 708 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDR1Q08345 913 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAB3GAP1Q15042 981 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 PI16Q6UXB8 463 aa34.04■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.044e-6■□□□□ 11.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXD4L1Q9NU39 408 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 PARP3Q9Y6F1 533 aa34.03■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBE4AQ14139 1066 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 RUFY3Q7L099 469 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 TAF1P21675 1872 aa34.02■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLD1P28340 1107 aa34.01■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRT32Q14532 448 aa34.01■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 APPBP2Q92624 585 aa34.01■■■■□ 3.04
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPS8P62241 208 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSBP2Q969R2 916 aa34.01■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 MINPP1Q9UNW1 487 aa34.01■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLFNL1Q499Z3 407 aa34■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPON1Q9HCB6 807 aa34■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 SERPINB2P05120 415 aa33.99■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 AK2P54819 239 aa33.99■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPATA5Q8NB90 893 aa33.99■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa33.99■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 M0R2C6 588 aa33.98■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 SNAP23O00161 211 aa33.98■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDRG1Q9NUG6 133 aa33.98■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 DOCK2Q92608 1830 aa33.98■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 NPHP1O15259 732 aa33.97■■■■□ 3.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms