RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.02■■□□□ 1.76
CCNDBP1-208ENST00000566515 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.01■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP126Q9P2H0 1117 aa26■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPC2Q8N158 579 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 RRAGCQ9HB90 399 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.99■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 COA1Q9GZY4 146 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDR90Q96KV7 1748 aa25.98■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGFR2P21802 821 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 TFCP2Q12800 502 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 PODNQ7Z5L7 613 aa25.97■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 GYG1P46976 350 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNIP1Q15025 636 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMD14O00487 310 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 CD209Q9NNX6 404 aa25.96■■□□□ 1.75
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSME4Q14997 1843 aa25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 POTECB2RU33 542 aa25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2B3Q16720 1220 aa25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 SASH1O94885 1247 aa25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 LPIN2Q92539 896 aa25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMMRO75330 724 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC5A1P13866 664 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCN4AP35499 1836 aa25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXW7Q969H0 707 aa25.92■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L3A6NCW0 530 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L4A6NCW7 530 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF3CO14782 793 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL1R1P14778 569 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 BCAMP50895 628 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCNN1DP51172 638 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIMM10P62072 90 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO33Q7Z6M2 555 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 VPS37DQ86XT2 251 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.9■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 GTF2IP78347 998 aa25.89■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.89■■□□□ 1.74
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.89■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1B0GUL7 405 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADORA1P30542 326 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 MXD3Q9BW11 206 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 HACL1Q9UJ83 578 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPS15P42566 896 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 JAG2Q9Y219 1238 aa25.88■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 DACT2Q5SW24 774 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.87■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 APBB1O00213 710 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF609O15014 1411 aa25.86■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 SHTN1A0MZ66 631 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 XAGE2Q96GT9 111 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPHX2P34913 555 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPF2Q92785 391 aa25.85■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.84■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNNI3KQ59H18 835 aa25.84■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.84■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHKA1P46020 1223 aa25.83■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 MICALL2Q8IY33 904 aa25.83■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.83■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR108Q9NPR9 543 aa25.83■■□□□ 1.73
CCNDBP1-208ENST00000566515 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.82■■□□□ 1.72
CCNDBP1-208ENST00000566515 GMLQ99445 158 aa25.82■■□□□ 1.72
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 162 ms