RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 MXD3Q9BW11 206 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 IFNL1Q8IU54 200 aa25.04■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 ERO1AQ96HE7 468 aa25.04■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 CHL1O00533 1208 aa25.03■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 DACT2Q5SW24 774 aa25.03■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.03■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.03■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 PDE8AO60658 829 aa25.02■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 HOXB7P09629 217 aa25.02■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 EN2P19622 333 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 GOLGA2Q08379 1002 aa25.02■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 NEUROD2Q15784 382 aa25.02■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPN22Q9Y2R2 807 aa25.02■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 MED23Q9ULK4 1368 aa25.01■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 STRIP1Q5VSL9 837 aa25■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 MYD88Q99836 296 aa25■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 FZD1Q9UP38 647 aa25■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 MMP14P50281 582 aa24.99■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.99■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.99■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 ARMC5Q96C12 935 aa24.98■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 EFCC1Q9HA90 598 aa24.98■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.97■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.97■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 WNK4Q96J92 1243 aa24.97■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 COA1Q9GZY4 146 aa24.97■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.96■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SEMA4B-211ENST00000559322 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.95■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 CRHR2Q13324 411 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 HTTP42858 3142 aa24.94■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 SP3Q02447 781 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 MAP3K11Q16584 847 aa24.93■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 CTSWP56202 376 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.91■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 DLGAP5Q15398 846 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 NBPF11Q86T75 865 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.9■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 UNCXA6NJT0 531 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 GTF2IP78347 998 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF333Q96JL9 665 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.89■■□□□ 1.58
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 CENPFP49454 3210 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 IREB2P48200 963 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 ARHGEF6Q15052 776 aa24.88■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO1BO43795 1136 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 GREM2Q9H772 168 aa24.87■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.86■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 H0YGN5 161 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 BRCA2P51587 3418 aa24.85■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 SPEF2Q9C093 1822 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 KLRK1P26718 216 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 GJA5P36382 358 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 KCNJ4P48050 445 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPN18Q99952 460 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 VEZTQ9HBM0 779 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 MBIPQ9NS73 344 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.84■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 LAMB1P07942 1786 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 CLRN2A0PK11 232 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 CAP1Q01518 475 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 RUNDC1Q96C34 613 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.83■■□□□ 1.57
SEMA4B-211ENST00000559322 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms