RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555928.5

MEG3-225, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEG3, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-225ENST00000555928 TM4SF4P48230 202 aa22.18■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 DACT2Q5SW24 774 aa22.18■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 WNT10BO00744 389 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 PRKG1Q13976 671 aa22.17■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.16■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 CENPFP49454 3210 aa22.15■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 ZNF853P0CG23 659 aa22.15■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 FZD1Q9UP38 647 aa22.15■■□□□ 1.14
MEG3-225ENST00000555928 CTSWP56202 376 aa22.14■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.14■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 GREM2Q9H772 168 aa22.14■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.14■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 LAMB1P07942 1786 aa22.14■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 NF2P35240 595 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 OGFOD1Q8N543 542 aa22.13■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 FKTNO75072 461 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 KLRK1P26718 216 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 SREBF2Q12772 1141 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.12■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.11■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.1■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 IGKV5-2P06315 115 aa22.1■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.1■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.1■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 IFT57Q9NWB7 429 aa22.1■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 A0A1B0GUL6 1792 aa22.1■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 SPRYD7Q5W111 196 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 COA1Q9GZY4 146 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 BRCA2P51587 3418 aa22.09■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.08■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 GNAI1P63096 354 aa22.08■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.08■■□□□ 1.13
MEG3-225ENST00000555928 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.07■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.06■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.06■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 TRIM17Q9Y577 477 aa22.06■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 OTOFQ9HC10 1997 aa22.06■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 POTEFA5A3E0 1075 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 APAF1O14727 1248 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 GTF2IP78347 998 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 KSR2Q6VAB6 950 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 TSPYL6Q8N831 410 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.05■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.04■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.04■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 IFNL1Q8IU54 200 aa22.04■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.04■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.03■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.03■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 ALDH1A1P00352 501 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 CERS5Q8N5B7 392 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 WNK4Q96J92 1243 aa22.02■■□□□ 1.12
MEG3-225ENST00000555928 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 SNAP23O00161 211 aa22.01■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 ITGA6P23229 1130 aa22.01■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.01■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 H7C1W4 665 aa22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 MMP14P50281 582 aa22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 G2E3Q7L622 706 aa22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 GCC1Q96CN9 775 aa22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 AOX1Q06278 1338 aa22■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 F8W031 263 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 DLGAP5Q15398 846 aa21.99■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 MAP3K11Q16584 847 aa21.99■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.99■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
MEG3-225ENST00000555928 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms