RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 SMC3Q9UQE7 1217 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 HAND2P61296 217 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 CHST3Q7LGC8 479 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 HMG20BQ9P0W2 317 aa25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 COL4A1P02462 1669 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 FGFR2P21802 821 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 BCAMP50895 628 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 LPIN2Q92539 896 aa24.99■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 FOXP2O15409 715 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 GJB2P29033 226 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 AK7Q96M32 723 aa24.98■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 SYT1P21579 422 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 Q6ZUG5 572 aa24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 CHRNDQ07001 517 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 RPS6KA4O75676 772 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.96■■□□□ 1.59
PRDM4-205ENST00000550376 ZPR1O75312 459 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 RASGRF1Q13972 1273 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.95■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 RREB1Q92766 1687 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 PPFIA3O75145 1194 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 SLC5A1P13866 664 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 NARFQ9UHQ1 456 aa24.94■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 TAF1P21675 1872 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 ABCC12Q96J65 1359 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 GPAA1O43292 621 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 KRT32Q14532 448 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 BRF1Q92994 677 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 SETDB2Q96T68 719 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 BTAF1O14981 1849 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 E7EWF7 191 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 FGAP02671 866 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 FGD1P98174 961 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 APPBP2Q92624 585 aa24.93■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 STX6O43752 255 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 SLC51AQ86UW1 340 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA5Q8NB90 893 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 GPT2Q8TD30 523 aa24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF532Q9HCE3 1301 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 ADD2P35612 726 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 GYG1P46976 350 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.89■■□□□ 1.58
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 JAK2O60674 1132 aa24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 APPP05067 770 aa24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 PDE6AP16499 860 aa24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD1Q15327 319 aa24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 APOBRQ0VD83 1088 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.88■■□□□ 1.57
PRDM4-205ENST00000550376 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
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