RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 WNK4Q96J92 1243 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 PTPN18Q99952 460 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SP3Q02447 781 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 PODNQ7Z5L7 613 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.88□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SASH1O94885 1247 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 PPP2R1AP30153 589 aa14.87□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SHISA4Q96DD7 197 aa14.86□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 NFE2L2Q16236 605 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 NBPF11Q86T75 865 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 CEP290O15078 2479 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-208ENST00000547298 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 OGFOD1Q8N543 542 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 XDHP47989 1333 aa14.83□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 ATP2B4P23634 1241 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 KRT24Q2M2I5 525 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 LRCH3Q96II8 777 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 DEFB129Q9H1M3 183 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 UNCXA6NJT0 531 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 DPF3Q92784 378 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 LAMA3Q16787 3333 aa14.81□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 MED23Q9ULK4 1368 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 MMP14P50281 582 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 MTFR1Q15390 333 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.79□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 AOX1Q06278 1338 aa14.77□□□□□ -0.04
CS-208ENST00000547298 A0A1W2PPC1 479 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 FBXW7Q969H0 707 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 COA1Q9GZY4 146 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.77□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 OPTNQ96CV9 577 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 PDE8AO60658 829 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 NEFMP07197 916 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 KLRK1P26718 216 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 CTGFP29279 349 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ARHGEF6Q15052 776 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 CERS5Q8N5B7 392 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ELP3Q9H9T3 547 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 GJA8P48165 433 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 GTF2IP78347 998 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-208ENST00000547298 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms