RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545464.5

MACROD1-208, Transcript of MACRO domain containing 1, human

TSL 3

Gene MACROD1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MACROD1-208	ENST00000545464	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		31.56	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	TBC1D8	O95759	1140 aa		31.55	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.55	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	GREM2	Q9H772	168 aa		31.55	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.54	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.54	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		31.54	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.53	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	DACT2	Q5SW24	774 aa		31.53	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.53	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	TSPYL6	Q8N831	410 aa		31.53	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	MED23	Q9ULK4	1368 aa		31.53	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	NF2	P35240	595 aa		31.52	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.52	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	PSME4	Q14997	1843 aa		31.52	■■■□□ 2.64
MACROD1-208	ENST00000545464	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		31.51	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	WNT10B	O00744	389 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	SASH1	O94885	1247 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	PRKG1	Q13976	671 aa		31.5	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.49	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	COA1	Q9GZY4	146 aa		31.49	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	31.46	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	SPEF2	Q9C093	1822 aa		31.46	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.45	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		31.45	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		31.45	■■■□□ 2.63
MACROD1-208	ENST00000545464	TM4SF4	P48230	202 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	GPR25	O00155	361 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	KLRK1	P26718	216 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	KCNJ4	P48050	445 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	GTF2I	P78347	998 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	SREBF2	Q12772	1141 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	G2E3	Q7L622	706 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464		H7C1W4	665 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	ITGA6	P23229	1130 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	31.39	■■■□□ 2.62
MACROD1-208	ENST00000545464	MYH3	P11055	1940 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	FZD1	Q9UP38	647 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	MMP14	P50281	582 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	GCKR	Q14397	625 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	FKTN	O75072	461 aa		31.36	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		31.36	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	DLGAP5	Q15398	846 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	CHRND	Q07001	517 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	SPRYD7	Q5W111	196 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	CD209	Q9NNX6	404 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
MACROD1-208	ENST00000545464	SNAP23	O00161	211 aa		31.32	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464		F8W031	263 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	TAF5L	O75529	589 aa		31.31	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	FLII	Q13045	1269 aa		31.31	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		31.3	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	CSF1R	P07333	972 aa		31.3	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	ALDH1A1	P00352	501 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	CASP7	P55210	303 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	CERS5	Q8N5B7	392 aa		31.28	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		31.28	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	CLRN2	A0PK11	232 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	WWC1	Q8IX03	1113 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MACROD1-208	ENST00000545464	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		31.27	■■■□□ 2.6

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