RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531188.5

RPS3-217, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 2,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-217ENST00000531188 PHKA1P46020 1223 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 ANAPC15P60006 121 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 CHRNDQ07001 517 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 LPIN2Q92539 896 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 NLRP3Q96P20 1036 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 PLSCR1O15162 318 aa14.65□□□□□ -0.06
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RPS3-217ENST00000531188 NEK4P51957 841 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 ZNF827Q17R98 1081 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 IL17RAQ96F46 866 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 FSD2A1L4K1 749 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 CCDC102BQ68D86 513 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 NPHP1O15259 732 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 MAP4K1Q92918 833 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 SLC5A1P13866 664 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 TM4SF1P30408 202 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 NECTIN1Q15223 517 aa14.63□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 ST18O60284 1047 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 CNBD1Q8NA66 436 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 FBXO41Q8TF61 875 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 AKT1S1Q96B36 256 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.62□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 DOCK2Q92608 1830 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 SERPINB2P05120 415 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 KCNJ4P48050 445 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 BCAMP50895 628 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 KCNB2Q92953 911 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 LAMA4Q16363 1823 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 CPA1P15085 419 aa14.6□□□□□ -0.07
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RPS3-217ENST00000531188 SLC51AQ86UW1 340 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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RPS3-217ENST00000531188 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 M0R2C6 588 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 SLC27A2O14975 620 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 OSBP2Q969R2 916 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 MAST3O60307 1309 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.076e-7■■■■□ 23.1
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RPS3-217ENST00000531188 RASGRF1Q13972 1273 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 VPS53Q5VIR6 699 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS3-217ENST00000531188 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.59□□□□□ -0.07
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RPS3-217ENST00000531188 MCM4P33991 863 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 MRE11P49959 708 aa14.58□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 TICAM2Q86XR7 235 aa14.58□□□□□ -0.08
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RPS3-217ENST00000531188 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 GYG1P46976 350 aa14.57□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 WASHC4Q2M389 1173 aa14.57□□□□□ -0.08
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RPS3-217ENST00000531188 KLRK1P26718 216 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 UBE4AQ14139 1066 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 TMX3Q96JJ7 454 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 ADD2P35612 726 aa14.56□□□□□ -0.08
RPS3-217ENST00000531188 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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