RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519617.1

CCNC-208, Transcript of cyclin C, human

TSL 3

Gene CCNC, Length 246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNC-208	ENST00000519617	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	HMX2	A2RU54	273 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	SCNN1A	P37088	669 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	CEP120	Q8N960	986 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	WNT8B	Q93098	351 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	PRMT3	O60678	531 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	ADAM11	O75078	769 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	WNT11	O96014	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	PTPRA	P18433	802 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	EPHA1	P21709	976 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	ZAP70	P43403	619 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.1	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	CDC25B	P30305	580 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	STIM2	Q9P246	746 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CCNC-208	ENST00000519617		H3BRJ5	948 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ZBTB39	O15060	712 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	BMP3	P12645	472 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	PREP	P48147	710 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ELP3	Q9H9T3	547 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	MEGF11	A6BM72	1044 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	NFKBIE	O00221	500 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	CABP4	P57796	275 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	XKR5	Q6UX68	686 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	STK32A	Q8WU08	396 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ATG7	O95352	703 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	NLRP12	P59046	1061 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	FZD5	Q13467	585 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	CES1	P23141	567 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ARL4D	P49703	201 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	MSMP	Q1L6U9	139 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CCNC-208	ENST00000519617	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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