RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.2■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 FKTNO75072 461 aa24.19■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 PRKG1Q13976 671 aa24.19■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.19■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.19■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.19■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 SASH1O94885 1247 aa24.18■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 LDLRAD1Q5T700 205 aa24.17■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 OGFOD1Q8N543 542 aa24.17■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.17■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 FZD1Q9UP38 647 aa24.17■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 MED23Q9ULK4 1368 aa24.16■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 NF2P35240 595 aa24.16■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 SREBF2Q12772 1141 aa24.16■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.16■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 SPRYD7Q5W111 196 aa24.16■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 FBXW7Q969H0 707 aa24.16■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 CTSWP56202 376 aa24.15■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 GREM2Q9H772 168 aa24.15■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
LINC00888-201ENST00000468380 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.14■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.14■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 COA1Q9GZY4 146 aa24.14■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 IGKV5-2P06315 115 aa24.13■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.13■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 HTTP42858 3142 aa24.13■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.12■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 POTEFA5A3E0 1075 aa24.12■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 KLRK1P26718 216 aa24.12■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.12■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.11■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 IFNL1Q8IU54 200 aa24.1■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 IFT57Q9NWB7 429 aa24.1■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 TRIM17Q9Y577 477 aa24.1■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 OTOP1Q7RTM1 612 aa24.09■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 GCC1Q96CN9 775 aa24.09■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 ALDH1A1P00352 501 aa24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 MMP14P50281 582 aa24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 GTF2IP78347 998 aa24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.08■■□□□ 1.45
LINC00888-201ENST00000468380 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 GNAI1P63096 354 aa24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 KSR2Q6VAB6 950 aa24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 TSPYL6Q8N831 410 aa24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa24.07■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 CENPFP49454 3210 aa24.06■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 SPEF2Q9C093 1822 aa24.06■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 INHBEP58166 350 aa24.06■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 MAP3K11Q16584 847 aa24.06■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.06■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 H7C1W4 665 aa24.05■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 APAF1O14727 1248 aa24.05■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.05■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 WNK4Q96J92 1243 aa24.05■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 CAP1Q01518 475 aa24.04■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 CERS5Q8N5B7 392 aa24.04■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.03■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.03■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 SNAP23O00161 211 aa24.03■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 CD209Q9NNX6 404 aa24.03■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.03■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 GJA5P36382 358 aa24.02■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 DLGAP5Q15398 846 aa24.02■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.02■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 AOX1Q06278 1338 aa24.02■■□□□ 1.44
LINC00888-201ENST00000468380 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 ITGA6P23229 1130 aa24.01■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 MTMR14Q8NCE2 650 aa24.01■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.01■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.01■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 MYH3P11055 1940 aa24.01■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 BRCA2P51587 3418 aa24■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 CRHR2Q13324 411 aa24■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 G2E3Q7L622 706 aa24■■□□□ 1.43
LINC00888-201ENST00000468380 PTPN18Q99952 460 aa24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.2 ms