RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.66■■■■■ 5.22
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LINC00888-201ENST00000468380 NACADO15069 1562 aa40.72■■■■■ 4.11
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LINC00888-201ENST00000468380 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.09
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LINC00888-201ENST00000468380 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.27■■■■□ 3.88
LINC00888-201ENST00000468380 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.27■■■■□ 3.88
LINC00888-201ENST00000468380 SCRIBQ14160 1630 aa39.11■■■■□ 3.85
LINC00888-201ENST00000468380 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
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LINC00888-201ENST00000468380 ERCC6Q03468 1493 aa37.58■■■■□ 3.61
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LINC00888-201ENST00000468380 NESP48681 1621 aa37.3■■■■□ 3.56
LINC00888-201ENST00000468380 SMARCA2P51531 1590 aa37.25■■■■□ 3.55
LINC00888-201ENST00000468380 HMGXB3Q12766 1538 aa37.25■■■■□ 3.55
LINC00888-201ENST00000468380 SMARCA4P51532 1647 aa37.25■■■■□ 3.55
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LINC00888-201ENST00000468380 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.82■■■■□ 3.48
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LINC00888-201ENST00000468380 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.68■■■■□ 3.46
LINC00888-201ENST00000468380 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.68■■■■□ 3.46
LINC00888-201ENST00000468380 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.52■■■■□ 3.44
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LINC00888-201ENST00000468380 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.38■■■■□ 3.41
LINC00888-201ENST00000468380 WDR62O43379 1518 aa36.3■■■■□ 3.4
LINC00888-201ENST00000468380 WIZO95785 1651 aa36.25■■■■□ 3.39
LINC00888-201ENST00000468380 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.11■■■■□ 3.37
LINC00888-201ENST00000468380 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.07■■■■□ 3.37
LINC00888-201ENST00000468380 OSCARQ8IYS5 282 aa35.98■■■■□ 3.35
LINC00888-201ENST00000468380 CFTRP13569 1480 aa35.97■■■■□ 3.35
LINC00888-201ENST00000468380 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
LINC00888-201ENST00000468380 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
LINC00888-201ENST00000468380 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
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LINC00888-201ENST00000468380 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.49■■■■□ 3.27
LINC00888-201ENST00000468380 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.49■■■■□ 3.27
LINC00888-201ENST00000468380 IFT140Q96RY7 1462 aa35.42■■■■□ 3.26
LINC00888-201ENST00000468380 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.41■■■■□ 3.26
LINC00888-201ENST00000468380 PRDM2Q13029 1718 aa35.38■■■■□ 3.25
LINC00888-201ENST00000468380 ARHGEF11O15085 1522 aa35.34■■■■□ 3.25
LINC00888-201ENST00000468380 TOPBP1Q92547 1522 aa35.33■■■■□ 3.25
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LINC00888-201ENST00000468380 ABCC8Q09428 1581 aa35.15■■■■□ 3.22
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LINC00888-201ENST00000468380 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.64■■■■□ 3.14
LINC00888-201ENST00000468380 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.64■■■■□ 3.14
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LINC00888-201ENST00000468380 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.14■■■■□ 3.06
LINC00888-201ENST00000468380 GRIN2AQ12879 1464 aa34.06■■■■□ 3.04
LINC00888-201ENST00000468380 NUP160Q12769 1436 aa34■■■■□ 3.03
LINC00888-201ENST00000468380 CEP170Q5SW79 1584 aa33.98■■■■□ 3.03
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LINC00888-201ENST00000468380 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.87■■■■□ 3.01
LINC00888-201ENST00000468380 SHROOM2Q13796 1616 aa33.85■■■■□ 3.01
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LINC00888-201ENST00000468380 JPH4Q96JJ6 628 aa33.73■■■□□ 2.99
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LINC00888-201ENST00000468380 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.69■■■□□ 2.98
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