RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
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USP21-201ENST00000289865 CTSWP56202 376 aa22.73■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ATP2B3Q16720 1220 aa22.73■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.73■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 H3BQV1 296 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 NUP98P52948 1817 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 IFFO2Q5TF58 517 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 SPATA32Q96LK8 384 aa22.72■■□□□ 1.23
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USP21-201ENST00000289865 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 MYH7P12883 1935 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 RESTQ13127 1097 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 PI16Q6UXB8 463 aa22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.71■■□□□ 1.23
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USP21-201ENST00000289865 CHST3Q7LGC8 479 aa22.71■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.71■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 LIG1P18858 919 aa22.7■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.7■■□□□ 1.23
USP21-201ENST00000289865 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
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USP21-201ENST00000289865 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 CCT2P78371 535 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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USP21-201ENST00000289865 CTDNEP1O95476 244 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 USP25Q9UHP3 1055 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 FOXP2O15409 715 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 FOSBP53539 338 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 KLHL34Q8N239 644 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 APPBP2Q92624 585 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.68■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.68■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 HAND2P61296 217 aa22.68■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.68■■□□□ 1.22
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USP21-201ENST00000289865 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.67■■□□□ 1.22
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USP21-201ENST00000289865 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.67■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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USP21-201ENST00000289865 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.66■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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USP21-201ENST00000289865 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.66■■□□□ 1.22
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USP21-201ENST00000289865 GPAA1O43292 621 aa22.65■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 CCDC192P0DO97 292 aa22.65■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 CAMK4Q16566 473 aa22.65■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 MAP3K11Q16584 847 aa22.65■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP21-201ENST00000289865 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.223e-6■□□□□ 9
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USP21-201ENST00000289865 A0A0G2JS52 829 aa22.64■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 PGBD1Q96JS3 809 aa22.64■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.64■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 PPFIA3O75145 1194 aa22.63■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 ADCY5O95622 1261 aa22.63■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 MCM5P33992 734 aa22.63■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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USP21-201ENST00000289865 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.63■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 BICD2Q8TD16 824 aa22.63■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 TNMDQ9H2S6 317 aa22.62■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 CFAP45Q9UL16 551 aa22.62■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 KDM4AO75164 1064 aa22.62■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.62■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 FBXL16Q8N461 479 aa22.62■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 PRC1O43663 620 aa22.61■■□□□ 1.21
USP21-201ENST00000289865 OFD1O75665 1012 aa22.61■■□□□ 1.21
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