RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173357.7

Nelfe-204, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Izumo3A6PWV3 263 aa30.32■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Atg4a-psA0A0G2JFS9 396 aa30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 A0A1W2P7S8 802 aa30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 DbnlQ62418 436 aa30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Atg4aQ8C9S8 396 aa30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Trmt44Q9D2Q2 713 aa30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Setdb1O88974 1307 aa30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mast3Q3U214 1321 aa30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kifc2O08672 792 aa30.3■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tom1l2Q5SRX1 507 aa30.3■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Abtb2Q7TQI7 1024 aa30.3■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa30.3■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Col24a1Q30D77 1733 aa30.3■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Riok1Q922Q2 567 aa30.29■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Slc4a1P04919 929 aa30.28■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 SkilQ60665 675 aa30.28■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dcdc2bF7BCK0 340 aa30.28■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Aldh8a1Q8BH00 487 aa30.28■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Polr3dQ91WD1 398 aa30.28■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Letm1Q9Z2I0 738 aa30.28■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Psmd14O35593 310 aa30.27■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Calr4Q3TQS0 420 aa30.27■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nlrp9aQ66X03 949 aa30.27■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gm2163Q6PCY5 473 aa30.27■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Sept9Q80UG5 583 aa30.27■■■□□ 2.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 EspnlQ3UYR4 1005 aa30.26■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa30.25■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Myh13B1AR69 1938 aa30.25■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Hoxa7P02830 229 aa30.25■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 NynrinQ5DTZ0 1840 aa30.24■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 LifrP42703 1092 aa30.24■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Klf15Q9EPW2 415 aa30.24■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Prl3d1P18121 224 aa30.23■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam160b2Q80YR2 744 aa30.23■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Glis2Q8VDL9 521 aa30.23■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Slc7a3P70423 618 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kif22Q3V300 660 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Krt25Q8VCW2 446 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Atl3Q91YH5 541 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Gcc1Q9D4H2 778 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tnip1Q9WUU8 647 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Myh3P13541 1940 aa30.22■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Prl7d1P04769 244 aa30.21■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa30.21■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ccdc27Q3V036 639 aa30.21■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cgnl1Q6AW69 1298 aa30.21■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rps12P63323 132 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Slc44a4Q91VA1 707 aa30.2■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dpp7Q9ET22 506 aa30.2■■■□□ 2.43
Nelfe-204ENSMUST00000173357 CpdO89001 1377 aa30.2■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ifi207E9Q3L4 978 aa30.19■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam83bQ0VBM2 1012 aa30.19■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Stag1Q9D3E6 1258 aa30.19■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Chd5A2A8L1 1946 aa30.19■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mapkapk5O54992 473 aa30.18■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ripk4Q9ERK0 786 aa30.18■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa30.18■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 GmpsQ3THK7 693 aa30.17■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pram1Q6BCL1 675 aa30.17■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 NyxP83503 476 aa30.16■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam84aQ9D650 292 aa30.16■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ube3bQ9ES34 1070 aa30.16■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 TnksQ6PFX9 1320 aa30.16■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam228bQ497Q6 232 aa30.15■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nme8Q715T0 586 aa30.15■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mmp14P53690 582 aa30.15■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mcm2P97310 904 aa30.15■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Large2Q5XPT3 690 aa30.15■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cetn4Q8K4K1 168 aa30.15■■■□□ 2.42
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ccdc146E9Q9F7 977 aa30.14■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tuft1O08970 390 aa30.14■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Taf5lQ91WQ5 589 aa30.14■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa30.14■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa30.13■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Zbtb45Q52KG4 520 aa30.13■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Erc2Q6PH08 957 aa30.13■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ptrh1Q8BW00 204 aa30.13■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 NsmfQ99NF2 532 aa30.13■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Stat5bP42232 786 aa30.12■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Rdm1Q9CQK3 281 aa30.12■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fam122aQ9DB52 284 aa30.12■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Vps54Q5SPW0 977 aa30.11■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Hdac9Q99N13 588 aa30.11■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mroh6V9GX81 722 aa30.11■■■□□ 2.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 95.1 ms