RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Atg2bQ80XK6 2075 aa20.34■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr110A2RT31 317 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcdh17E9PXF0 1157 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm20390E9PZF0 267 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 C2cd6E9Q152 557 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp616J3QN14 987 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21833J3QPK1 500 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Vmn2r51L7N215 852 aa20.33■□□□□ 0.85
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Elavl1P70372 326 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Anxa11P97384 503 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nme2Q01768 152 aa20.33■□□□□ 0.85
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1126Q7TR49 314 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr111Q7TRK1 317 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gpr137bQ8BNQ3 385 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ing4Q8C0D7 249 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1395Q8VGD7 317 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa20.33■□□□□ 0.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Msantd3Q9CR78 275 aa20.33■□□□□ 0.85
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm3543D3Z235 184 aa20.33■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm10912Q3UXH0 145 aa20.33■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tnfsfm13Q8BXS2 410 aa20.33■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1090Q8VGA6 313 aa20.33■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem150cQ8C8S3 249 aa20.32■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Foxo1Q9R1E0 652 aa20.32■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trav12-2A0N8N6 114 aa20.32■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CK137956B1AYM9 596 aa20.32■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rft1Q8C3B8 541 aa20.32■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr73Q920P2 313 aa20.32■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trp53tg5Q9D976 238 aa20.32■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 P2rx4Q9JJX6 388 aa20.32■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ClnkQ9QZE2 435 aa20.32■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf346Q9R0B7 294 aa20.32■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rhox1B1APN4 224 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prdm13E9PZZ1 754 aa20.31■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr13P34984 310 aa20.31■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 MallQ91X49 154 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Asb10Q91ZT7 467 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Polr2hQ923G2 150 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il24Q925S4 181 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eif2b1Q99LC8 305 aa20.31■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pcnx3Q8VI59 2028 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21858A0A087WQ24 222 aa20.31■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 GipP48756 144 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sec61a1P61620 476 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ptpn21Q62136 1176 aa20.31■□□□□ 0.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cnppd1Q8K158 407 aa20.31■□□□□ 0.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 MeiobQ9D513 470 aa20.31■□□□□ 0.84
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