Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Trav12-2A0N8N6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trav12-2A0N8N6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trav12-2A0N8N6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trav12-2A0N8N6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trav12-2A0N8N6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trav12-2A0N8N6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trav12-2A0N8N6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Trav12-2A0N8N6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trav12-2A0N8N6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trav12-2A0N8N6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trav12-2A0N8N6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trav12-2A0N8N6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Trav12-2A0N8N6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trav12-2A0N8N6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trav12-2A0N8N6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trav12-2A0N8N6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trav12-2A0N8N6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trav12-2A0N8N6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trav12-2A0N8N6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trav12-2A0N8N6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trav12-2A0N8N6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trav12-2A0N8N6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trav12-2A0N8N6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trav12-2A0N8N6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trav12-2A0N8N6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trav12-2A0N8N6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trav12-2A0N8N6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trav12-2A0N8N6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trav12-2A0N8N6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trav12-2A0N8N6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trav12-2A0N8N6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Trav12-2A0N8N6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trav12-2A0N8N6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trav12-2A0N8N6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trav12-2A0N8N6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trav12-2A0N8N6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trav12-2A0N8N6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trav12-2A0N8N6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trav12-2A0N8N6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trav12-2A0N8N6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trav12-2A0N8N6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trav12-2A0N8N6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trav12-2A0N8N6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trav12-2A0N8N6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Trav12-2A0N8N6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trav12-2A0N8N6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trav12-2A0N8N6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trav12-2A0N8N6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trav12-2A0N8N6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trav12-2A0N8N6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trav12-2A0N8N6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trav12-2A0N8N6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trav12-2A0N8N6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trav12-2A0N8N6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trav12-2A0N8N6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trav12-2A0N8N6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trav12-2A0N8N6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trav12-2A0N8N6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Trav12-2A0N8N6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trav12-2A0N8N6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trav12-2A0N8N6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trav12-2A0N8N6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trav12-2A0N8N6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trav12-2A0N8N6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trav12-2A0N8N6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trav12-2A0N8N6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trav12-2A0N8N6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trav12-2A0N8N6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trav12-2A0N8N6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trav12-2A0N8N6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trav12-2A0N8N6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trav12-2A0N8N6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trav12-2A0N8N6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trav12-2A0N8N6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trav12-2A0N8N6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trav12-2A0N8N6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trav12-2A0N8N6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trav12-2A0N8N6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trav12-2A0N8N6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trav12-2A0N8N6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trav12-2A0N8N6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trav12-2A0N8N6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trav12-2A0N8N6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trav12-2A0N8N6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trav12-2A0N8N6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trav12-2A0N8N6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trav12-2A0N8N6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trav12-2A0N8N6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trav12-2A0N8N6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trav12-2A0N8N6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trav12-2A0N8N6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trav12-2A0N8N6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trav12-2A0N8N6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trav12-2A0N8N6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trav12-2A0N8N6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trav12-2A0N8N6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trav12-2A0N8N6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trav12-2A0N8N6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trav12-2A0N8N6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms