Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Syngr3Q8R191 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Syngr3Q8R191 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Syngr3Q8R191 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Syngr3Q8R191 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Syngr3Q8R191 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Syngr3Q8R191 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Syngr3Q8R191 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Syngr3Q8R191 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Syngr3Q8R191 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Syngr3Q8R191 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Syngr3Q8R191 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Syngr3Q8R191 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Syngr3Q8R191 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Syngr3Q8R191 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Syngr3Q8R191 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Syngr3Q8R191 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Syngr3Q8R191 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Syngr3Q8R191 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Syngr3Q8R191 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Syngr3Q8R191 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Syngr3Q8R191 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Syngr3Q8R191 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Syngr3Q8R191 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Syngr3Q8R191 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Syngr3Q8R191 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Syngr3Q8R191 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syngr3Q8R191 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syngr3Q8R191 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Syngr3Q8R191 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Syngr3Q8R191 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Syngr3Q8R191 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Syngr3Q8R191 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Syngr3Q8R191 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Syngr3Q8R191 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Syngr3Q8R191 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Syngr3Q8R191 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Syngr3Q8R191 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Syngr3Q8R191 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Syngr3Q8R191 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syngr3Q8R191 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Syngr3Q8R191 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Syngr3Q8R191 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Syngr3Q8R191 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Syngr3Q8R191 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Syngr3Q8R191 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syngr3Q8R191 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syngr3Q8R191 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Syngr3Q8R191 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syngr3Q8R191 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Syngr3Q8R191 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Syngr3Q8R191 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Syngr3Q8R191 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Syngr3Q8R191 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Syngr3Q8R191 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Syngr3Q8R191 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Syngr3Q8R191 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Syngr3Q8R191 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Syngr3Q8R191 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syngr3Q8R191 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syngr3Q8R191 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Syngr3Q8R191 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syngr3Q8R191 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syngr3Q8R191 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syngr3Q8R191 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syngr3Q8R191 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Syngr3Q8R191 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Syngr3Q8R191 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Syngr3Q8R191 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syngr3Q8R191 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Syngr3Q8R191 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syngr3Q8R191 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syngr3Q8R191 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syngr3Q8R191 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syngr3Q8R191 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syngr3Q8R191 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syngr3Q8R191 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syngr3Q8R191 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Syngr3Q8R191 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syngr3Q8R191 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syngr3Q8R191 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syngr3Q8R191 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Syngr3Q8R191 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syngr3Q8R191 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syngr3Q8R191 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syngr3Q8R191 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syngr3Q8R191 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Syngr3Q8R191 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syngr3Q8R191 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syngr3Q8R191 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syngr3Q8R191 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syngr3Q8R191 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syngr3Q8R191 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syngr3Q8R191 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Syngr3Q8R191 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngr3Q8R191 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syngr3Q8R191 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Syngr3Q8R191 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syngr3Q8R191 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Syngr3Q8R191 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms