Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rarres1F6ZIS7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rarres1F6ZIS7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rarres1F6ZIS7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rarres1F6ZIS7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rarres1F6ZIS7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rarres1F6ZIS7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rarres1F6ZIS7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rarres1F6ZIS7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rarres1F6ZIS7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rarres1F6ZIS7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rarres1F6ZIS7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rarres1F6ZIS7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rarres1F6ZIS7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rarres1F6ZIS7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rarres1F6ZIS7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rarres1F6ZIS7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rarres1F6ZIS7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rarres1F6ZIS7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rarres1F6ZIS7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rarres1F6ZIS7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rarres1F6ZIS7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rarres1F6ZIS7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rarres1F6ZIS7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rarres1F6ZIS7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rarres1F6ZIS7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rarres1F6ZIS7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rarres1F6ZIS7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rarres1F6ZIS7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rarres1F6ZIS7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rarres1F6ZIS7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rarres1F6ZIS7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rarres1F6ZIS7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rarres1F6ZIS7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rarres1F6ZIS7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rarres1F6ZIS7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rarres1F6ZIS7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rarres1F6ZIS7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rarres1F6ZIS7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rarres1F6ZIS7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rarres1F6ZIS7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rarres1F6ZIS7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rarres1F6ZIS7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rarres1F6ZIS7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rarres1F6ZIS7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rarres1F6ZIS7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rarres1F6ZIS7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rarres1F6ZIS7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rarres1F6ZIS7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rarres1F6ZIS7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rarres1F6ZIS7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rarres1F6ZIS7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rarres1F6ZIS7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rarres1F6ZIS7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rarres1F6ZIS7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rarres1F6ZIS7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rarres1F6ZIS7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rarres1F6ZIS7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rarres1F6ZIS7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rarres1F6ZIS7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rarres1F6ZIS7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rarres1F6ZIS7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rarres1F6ZIS7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rarres1F6ZIS7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rarres1F6ZIS7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rarres1F6ZIS7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rarres1F6ZIS7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rarres1F6ZIS7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rarres1F6ZIS7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rarres1F6ZIS7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rarres1F6ZIS7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rarres1F6ZIS7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rarres1F6ZIS7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rarres1F6ZIS7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rarres1F6ZIS7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rarres1F6ZIS7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rarres1F6ZIS7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rarres1F6ZIS7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rarres1F6ZIS7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rarres1F6ZIS7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rarres1F6ZIS7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rarres1F6ZIS7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rarres1F6ZIS7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rarres1F6ZIS7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rarres1F6ZIS7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rarres1F6ZIS7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rarres1F6ZIS7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rarres1F6ZIS7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rarres1F6ZIS7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rarres1F6ZIS7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rarres1F6ZIS7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rarres1F6ZIS7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rarres1F6ZIS7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rarres1F6ZIS7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rarres1F6ZIS7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rarres1F6ZIS7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rarres1F6ZIS7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rarres1F6ZIS7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rarres1F6ZIS7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rarres1F6ZIS7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms