Protein–RNA interactions for Protein: O54940

Bnip2, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip2O54940 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Bnip2O54940 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Bnip2O54940 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bnip2O54940 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Bnip2O54940 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Bnip2O54940 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Bnip2O54940 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bnip2O54940 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Bnip2O54940 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bnip2O54940 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Bnip2O54940 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bnip2O54940 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Bnip2O54940 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Bnip2O54940 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Bnip2O54940 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Bnip2O54940 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bnip2O54940 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bnip2O54940 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bnip2O54940 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bnip2O54940 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Bnip2O54940 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bnip2O54940 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bnip2O54940 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip2O54940 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bnip2O54940 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bnip2O54940 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bnip2O54940 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bnip2O54940 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Bnip2O54940 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bnip2O54940 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bnip2O54940 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bnip2O54940 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Bnip2O54940 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip2O54940 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip2O54940 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bnip2O54940 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bnip2O54940 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bnip2O54940 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bnip2O54940 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bnip2O54940 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bnip2O54940 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bnip2O54940 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bnip2O54940 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bnip2O54940 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Bnip2O54940 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bnip2O54940 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bnip2O54940 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Bnip2O54940 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bnip2O54940 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bnip2O54940 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bnip2O54940 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bnip2O54940 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bnip2O54940 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bnip2O54940 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bnip2O54940 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip2O54940 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bnip2O54940 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Bnip2O54940 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bnip2O54940 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bnip2O54940 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bnip2O54940 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bnip2O54940 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Bnip2O54940 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bnip2O54940 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bnip2O54940 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bnip2O54940 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bnip2O54940 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip2O54940 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bnip2O54940 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bnip2O54940 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip2O54940 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bnip2O54940 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip2O54940 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bnip2O54940 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bnip2O54940 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip2O54940 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bnip2O54940 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bnip2O54940 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bnip2O54940 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bnip2O54940 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bnip2O54940 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnip2O54940 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bnip2O54940 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bnip2O54940 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bnip2O54940 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bnip2O54940 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Bnip2O54940 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bnip2O54940 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Bnip2O54940 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bnip2O54940 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bnip2O54940 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnip2O54940 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bnip2O54940 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bnip2O54940 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bnip2O54940 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bnip2O54940 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bnip2O54940 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bnip2O54940 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bnip2O54940 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bnip2O54940 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms