RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRP9P49458 86 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC36A3Q495N2 470 aa22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4K13Q8NH42 304 aa22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCUR1Q96AQ8 359 aa22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRI1Q9BV20 369 aa22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INSIG2Q9Y5U4 225 aa22■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEACAM18A8MTB9 384 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCF6A8MYZ5 107 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD17B1P14061 328 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOS3P29474 1203 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNGR2P38484 337 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00346Q8IVM7 164 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BHLHE23Q8NDY6 225 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC30A2Q9BRI3 323 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCAR1Q9BXC0 346 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR76Q9H967 626 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR5V1Q9UGF6 321 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP50Q9UKX7 468 aa21.99■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H0YL77 283 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELEP16581 610 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBA52P62987 128 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC18B1Q6NT16 456 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFAP77Q6ZQR2 320 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COLCA1Q6ZS62 124 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB46Q86UZ6 589 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSMCE2Q96MF7 247 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITX2Q99697 317 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDADC1Q9BWV3 514 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRCH1Q9Y2L9 728 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIAL4AQ9Y536 164 aa21.98■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLNRO43193 412 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IDH3BO43837 385 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX3O60493 162 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FABP3P05413 133 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT2P09544 360 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPT2P23786 658 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ECH1Q13011 328 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM165Q9HC07 324 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM100Q9NV29 134 aa21.97■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC30A6NM36 301 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F5H5K5 113 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F5H5P2 479 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF205O95201 554 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DQA2P01906 255 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSM4P0C7M7 580 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS2P15880 293 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRM2P31350 389 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSSP48637 474 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOGAT3Q86VF5 341 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDR9C7Q8NEX9 313 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATF6BQ99941 703 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FN3KQ9H479 309 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF69Q9UC07 566 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa21.96■■□□□ 1.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6C68A6NDL8 312 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPC2O15144 300 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MALLQ13021 153 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF181Q2M3W8 571 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOK3Q7L591 496 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52E2Q8NGJ4 325 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDRT15Q96T59 188 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1RAPQ9NPH3 570 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIOXQ9UGB7 285 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD300AQ9UGN4 299 aa21.95■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1B0GWJ7 208 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCATP04180 440 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGT2P36268 569 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS12P56730 875 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN31Q12999 210 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUSC1Q2TAM9 212 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLBQ86Z14 1044 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf87Q8N0U7 546 aa21.94■■□□□ 1.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DPB1P04440 258 aa21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms