RNA–Protein interactions for RNA: YLR073C

RFU1, Transcript of Protein that inhibits Doa4p deubiquitinating activity, yeast

Gene RFU1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RFU1	YLR073C	SOH1	P38633	127 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YFL034W	P43564	1073 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	ERP6	P53198	216 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YNL058C	P53947	316 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YNL034W	P53963	612 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YNL018C	P53976	612 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	ESC2	Q06340	456 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YPL260W	Q08977	551 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	MED1	Q12321	566 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YOL087C	Q99247	1116 aa		5	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.99	□□□□□ -1.61	not detected
RFU1	YLR073C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	ARE1	P25628	610 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	NIC96	P34077	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YHR218W	P38899	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	POP2	P39008	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	FMP10	P40098	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	VPS53	P47061	822 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	TGL2	P54857	326 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	CDC55	Q00362	526 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	OPY2	Q06810	360 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	ERP3	Q12403	225 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	MOT1	P32333	1867 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	URK1	P27515	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	IMP2'	P32351	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	MCM10	P32354	571 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	GPT2	P36148	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YBR184W	P38299	523 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	NPR3	P38742	1146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	HXT8	P40886	569 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	AVT1	P47082	602 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YGR053C	P53234	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	SOL4	P53315	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	HFD1	Q04458	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	MLC2	Q06580	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	PSR1	Q07800	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	TRM11	Q12463	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	GAL1	P04385	528 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	TEC1	P18412	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	BAS1	P22035	811 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	NPR1	P22211	790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	GUT2	P32191	649 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	PLC1	P32383	869 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	TFC4	P33339	1025 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	TGL1	P34163	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YKL069W	P36088	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	FLR1	P38124	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	AZR1	P50080	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	YNL011C	P53980	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	GRX3	Q03835	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	EAF1	Q06337	982 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RFU1	YLR073C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	MAS2	P11914	482 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PHO81	P17442	1178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	DUR3	P33413	735 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	MRP8	P35719	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	TVP23	P38962	199 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	VPS8	P39702	1274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PRY1	P47032	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	FRA1	Q07825	749 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	APC5	Q08683	685 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	STF1	P01098	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	SWI6	P09959	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	IDI1	P15496	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	PGS1	P25578	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	DBF20	P32328	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	HSP78	P33416	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	BAP2	P38084	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	POA1	P38218	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RFU1	YLR073C	REG2	P38232	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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