RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C-A

VMA10, Transcript of Subunit G of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA10, Length 345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA10	YHR039C-A	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	YDR338C	Q05497	695 aa		3.95	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	CTF13	P35203	478 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	GRX7	P38068	203 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	YBR071W	P38243	211 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	HSL7	P38274	827 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	BUL1	P48524	976 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	PEX8	P53248	589 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	SUN4	P53616	420 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	ASI2	P53895	289 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	COG6	P53959	839 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	YOL057W	Q08225	711 aa		3.94	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	ZIP2	P53061	704 aa		3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	CRR1	Q05790	422 aa		3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	AIM39	Q08223	395 aa		3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	PUS9	Q12069	462 aa		3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	TRM11	Q12463	433 aa		3.93	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	RPP1	P38786	293 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	PFA3	P42836	336 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	MSE1	P48525	536 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	MRPS35	P53292	345 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	KIN4	Q01919	800 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	PKH1	Q03407	766 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	ASM4	Q05166	528 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	GPR1	Q12361	961 aa		3.92	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	TPM2	P40414	161 aa		3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	AIM21	P40563	679 aa		3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	BNA2	P47125	453 aa		3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	TRE2	Q08693	809 aa		3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	TRM13	Q12383	476 aa		3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	YLR149C	Q99296	730 aa		3.91	□□□□□ -1.78
VMA10	YHR039C-A	YLR415C	O13578	112 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	ERG4	P25340	473 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	NGG1	P32494	702 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YKR051W	P36142	418 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	FKH2	P41813	862 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	RET2	P43621	546 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	NPY1	P53164	384 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	ECM9	Q02202	377 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YLR040C	Q07988	224 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.9	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	PLC1	P32383	869 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	DID4	P36108	232 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YKR018C	P36114	725 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	KTR4	P38131	464 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YFL052W	P43551	465 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	NIT2	P47016	307 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YGR153W	P48238	217 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	PEX14	P53112	341 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	TGL2	P54857	326 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	SND1	Q04007	877 aa		3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	AEP2	P22136	580 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	SEC6	P32844	805 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	TFC4	P33339	1025 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	SUL1	P38359	859 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	TDA3	P38758	523 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	HXT7	P39004	570 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	SLI1	P53304	468 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	NRG1	Q03125	231 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	SLX4	Q12098	748 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	DCS2	Q12123	353 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	PNS1	Q12412	539 aa		3.88	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	TOP1	P04786	769 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	MET3	P08536	511 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	DAL3	P32459	195 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	MNN4	P36044	1178 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	CHS7	P38843	316 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	ELO3	P40319	345 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	MUP1	P50276	574 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YNL034W	P53963	612 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YNL018C	P53976	612 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	ARP4	P80428	489 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	RNT1	Q02555	471 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	DLT1	Q04216	342 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YOL073C	Q08232	322 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	YOR378W	Q08902	515 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	HFI1	Q12060	488 aa		3.87	□□□□□ -1.79
VMA10	YHR039C-A	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79

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