RNA–Protein interactions for RNA: YHR009C

TDA3, Transcript of Putative oxidoreductase involved in late endosome to Golgi transport, yeast

Gene TDA3, Length 1,572 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TDA3	YHR009C	BFA1	P47113	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CHS2	P14180	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	DBF20	P32328	564 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SKN7	P38889	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	QRI7	P43122	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SSY5	P47002	699 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	PSR2	Q07949	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
TDA3	YHR009C	ADP1	P25371	1049 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	TAT1	P38085	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	EXO84	P38261	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	BEM4	P39011	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	ACA1	P39970	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	VID27	P40157	782 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CMP2	P14747	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	COQ2	P32378	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CTF8	P38877	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YLR122C	Q12312	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SPE1	P08432	466 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	HOP1	P20050	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YKR075C	P36155	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YHR078W	P38799	552 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	ERP2	P39704	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SDP1	P40479	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	MND2	P40577	368 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SAP185	P40856	1058 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CDC26	P14724	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	ATG19	P35193	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YHR202W	P38887	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	VID28	P40547	921 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	HOL1	P53389	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	ASM4	Q05166	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YLR407W	Q06070	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	OMS1	Q06668	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	GPR1	Q12361	961 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	PHO81	P17442	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SSH4	P32343	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	SAK1	P38990	1142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	ASK10	P48361	1146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	COG4	Q06096	861 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	MCA1	Q08601	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TDA3	YHR009C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	GAL10	P04397	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	HXT4	P32467	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	EAF5	P39995	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YIL092W	P40497	633 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	TEP1	P53916	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ORC4	P54791	529 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YML131W	Q03102	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	NUR1	Q12066	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	KAE1	P36132	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PZF1	P39933	429 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	IES1	P43579	692 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	IRC5	P43610	853 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YGR130C	P53278	816 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	HIM1	Q06674	414 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MSM1	P22438	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	PHO3	P24031	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	STE14	P32584	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	APN2	P38207	520 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ORC3	P54790	616 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	HLR1	Q04429	423 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	CIA1	Q05583	330 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	ADY3	Q07732	790 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	TPO1	Q07824	586 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TDA3	YHR009C	UPC2	Q12151	913 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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