RNA–Protein interactions for RNA: YDR138W

HPR1, Transcript of Subunit of THO/TREX complexes, yeast

Gene HPR1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HPR1	YDR138W	VID28	P40547	921 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	IMA5	P40884	581 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MAD3	P47074	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	DIF1	O13577	133 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SAN1	P22470	610 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RRT14	P40470	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	DSE4	P53753	1117 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YPS7	Q06325	596 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	FBP1	P09201	348 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	ZIP2	P53061	704 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PCL10	P53124	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.76	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PSY4	P38193	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	LAM1	P38851	1228 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PIK1	P39104	1066 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	ACO2	P39533	789 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MAD2	P40958	196 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	IES1	P43579	692 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YAP1802	P53309	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
HPR1	YDR138W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PHO3	P24031	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	ADP1	P25371	1049 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	TRK2	P28584	889 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	AXL2	P38928	823 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	TRM8	Q12009	286 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	DIN7	Q12086	430 aa		4.75	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	INH1	P01097	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PHO81	P17442	1178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RRN3	P36070	627 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RRM3	P38766	723 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PUG1	P40100	303 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	IML2	P47031	731 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YVC1	Q12324	675 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	ARP7	Q12406	477 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	NHA1	Q99271	985 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MET8	P15807	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	IME1	P21190	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MET22	P32179	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	BLS1	Q06071	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	AAC3	P18238	307 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	TOA1	P32773	286 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SCT1	P32784	759 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SWD1	P39706	426 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SHR5	P41912	237 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	ARA2	Q04212	335 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	OPY2	Q06810	360 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PHM7	Q12252	991 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SVS1	Q12254	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	NSI1	Q12457	570 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	PRC1	P00729	532 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MSH1	P25846	959 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	APM3	P38153	483 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	IFA38	P38286	347 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	STP4	Q07351	490 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	HIF1	Q12373	385 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MTF2	P10849	440 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	CMP2	P14747	604 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YBR138C	P38277	524 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	STL1	P39932	569 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YFL052W	P43551	465 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	CDA1	Q06702	301 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RSC58	Q07979	502 aa		4.72	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SAP190	P36123	1033 aa		4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SET3	P36124	751 aa		4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	TMA108	P40462	946 aa		4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	MCH5	Q08777	521 aa		4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	OSW2	Q12202	724 aa		4.71	□□□□□ -1.65
HPR1	YDR138W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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