RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618075.4

MLF1-216, Transcript of myeloid leukemia factor 1, human

TSL 5 BASIC

Gene MLF1, Length 2,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLF1-216	ENST00000618075	SCARF1	Q14162	830 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		18.61	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	LRP5	O75197	1615 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	18.6	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	SNRK	Q9NRH2	765 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	ABCC12	Q96J65	1359 aa		18.6	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	RASEF	Q8IZ41	740 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	PDE8B	O95263	885 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	PI16	Q6UXB8	463 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	PROM2	Q8N271	834 aa		18.59	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	TAF5L	O75529	589 aa		18.58	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	MCC	P23508	829 aa		18.58	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		18.58	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	SETDB2	Q96T68	719 aa		18.58	■□□□□ 0.57
MLF1-216	ENST00000618075	HIP1	O00291	1037 aa		18.58	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	GORAB	Q5T7V8	394 aa		18.58	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		18.58	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	RFC4	P35249	363 aa		18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	NEK4	P51957	841 aa		18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	MED23	Q9ULK4	1368 aa		18.57	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	ANAPC15	P60006	121 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	IL17RA	Q96F46	866 aa		18.56	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	FGFR2	P21802	821 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	RTL9	Q8NET4	1388 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	RGL2	O15211	777 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	ZAP70	P43403	619 aa		18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	DDIT3	P35638	169 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	MCAM	P43121	646 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	18.54	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	MAP4K1	Q92918	833 aa		18.54	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	18.54	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	ST18	O60284	1047 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	PHKA1	P46020	1223 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	NECTIN1	Q15223	517 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	NFKBIB	Q15653	356 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	CPA1	P15085	419 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	NFIX	Q14938	502 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	TXNRD1	Q16881	649 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		18.53	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	CCDC102B	Q68D86	513 aa		18.52	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
MLF1-216	ENST00000618075	CHRND	Q07001	517 aa		18.52	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	LPIN2	Q92539	896 aa		18.52	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	NYX	Q9GZU5	481 aa		18.52	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		18.52	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		18.51	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	RXRB	P28702	533 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	GYS1	P13807	737 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	KCNB2	Q92953	911 aa		18.5	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	KCNJ4	P48050	445 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	VPS53	Q5VIR6	699 aa		18.49	■□□□□ 0.55
MLF1-216	ENST00000618075	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.49	■□□□□ 0.55

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