RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592763.5

ILF3-222, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ILF3, Length 3,866 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-222	ENST00000592763	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.92	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	TRAK2	O60296	914 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	CPLX1	O14810	134 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	TDO2	P48775	406 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	AOX1	Q06278	1338 aa		12.91	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	AK2	P54819	239 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	MAP3K12	Q12852	859 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	SNX21	Q969T3	373 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	C6orf229	H3BNL8	230 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.9	□□□□□ -0.34
ILF3-222	ENST00000592763	PHKA1	P46020	1223 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	BCAM	P50895	628 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CNBD1	Q8NA66	436 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	MSL1	Q68DK7	614 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RAD50	Q92878	1312 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.89	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	FIBP	O43427	364 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	GYG1	P46976	350 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	BRF1	Q92994	677 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	NEK1	Q96PY6	1258 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	PDE8B	O95263	885 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF213	O14771	459 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	HSPA4	P34932	840 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC102B	Q68D86	513 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	HAUS7	Q99871	368 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	NAPB	Q9H115	298 aa		12.88	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	BCL9	O00512	1426 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	NYX	Q9GZU5	481 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	SLC27A2	O14975	620 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ANAPC15	P60006	121 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	PKP1	Q13835	747 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	LPIN2	Q92539	896 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	12.87	□□□□□ -0.35	1e-10	■■□□□ 11.5
ILF3-222	ENST00000592763	KIF2C	Q99661	725 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	UTY	O14607	1347 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RGPD5	Q99666	1765 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	COL15A1	P39059	1388 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CHRND	Q07001	517 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	KRT32	Q14532	448 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	VPS53	Q5VIR6	699 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		12.87	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	SCARF1	Q14162	830 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	RAD21	O60216	631 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CAMTA2	O94983	1202 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	CYP7A1	P22680	504 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	GUCY1B3	Q02153	619 aa		12.86	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ILF3-222	ENST00000592763	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		12.85	□□□□□ -0.35

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