RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TSPY2A6NKD2 308 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 POTEJP0CG39 1038 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SLC39A6Q13433 755 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 ERMNQ8TAM6 284 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 VPS33BQ9H267 617 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CHPF2Q9P2E5 772 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 MADDQ8WXG6 1647 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CDC37L1Q7L3B6 337 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 LPIN2Q92539 896 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-212ENST00000591126 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TSPY3P0CV98 308 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TSPY8P0CW00 308 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CYP7A1P22680 504 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 ODR4Q5SWX8 454 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 NOD1Q9Y239 953 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 KCNQ2O43526 872 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 BMP15O95972 392 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 ERFEQ4G0M1 354 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 ODF2Q5BJF6 829 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 HACE1Q8IYU2 909 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-212ENST00000591126 DACH1Q9UI36 760 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
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SMAD4-212ENST00000591126 NUCB2P80303 420 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 UBE4AQ14139 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 FAM161AQ3B820 660 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.36□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 MINDY4BA8MYZ0 360 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 RIMBP2O15034 1052 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 NRXN1Q9ULB1 1477 aa7.35□□□□□ -1.23
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SMAD4-212ENST00000591126 MMP10P09238 476 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SYCP1Q15431 976 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TICAM2Q86XR7 235 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 RTL9Q8NET4 1388 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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SMAD4-212ENST00000591126 SLC15A2Q16348 729 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 CHURC1Q8WUH1 139 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TESK2Q96S53 571 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 LZTS2Q9BRK4 669 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 COA1Q9GZY4 146 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 NBPF3Q9H094 633 aa7.35□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 M0QZ92 97 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SREBF2Q12772 1141 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 PPP2R5BQ15173 497 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SLIT1O75093 1534 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMAD4-212ENST00000591126 RABEP1Q15276 862 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 TEX11Q8IYF3 940 aa7.34□□□□□ -1.23
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SMAD4-212ENST00000591126 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 ATP10DQ9P241 1426 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 ABCA6Q8N139 1617 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 EYA2O00167 538 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 MX1P20591 662 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 GCKRQ14397 625 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 STYK1Q6J9G0 422 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 DRC7Q8IY82 874 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 MIS18AQ9NYP9 233 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 RNF181Q9P0P0 153 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.34□□□□□ -1.23
SMAD4-212ENST00000591126 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.34□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 SSH2Q76I76 1423 aa7.34□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 CCDC17Q96LX7 622 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 HACL1Q9UJ83 578 aa7.33□□□□□ -1.24
SMAD4-212ENST00000591126 MTMR7Q9Y216 660 aa7.33□□□□□ -1.24
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