RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 GPSM2P81274 684 aa25.34■■□□□ 1.65
SEMA4B-211ENST00000559322 NFE2L2Q16236 605 aa25.34■■□□□ 1.65
SEMA4B-211ENST00000559322 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.34■■□□□ 1.65
SEMA4B-211ENST00000559322 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SEMA4B-211ENST00000559322 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SEMA4B-211ENST00000559322 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.33■■□□□ 1.65
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF428Q96B54 188 aa25.33■■□□□ 1.65
SEMA4B-211ENST00000559322 NECTIN2Q92692 538 aa25.32■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 SCARF1Q14162 830 aa25.31■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.3■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 GPR25O00155 361 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.28■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 MOB2Q70IA6 237 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM89AQ96GI7 184 aa25.27■■□□□ 1.64
SEMA4B-211ENST00000559322 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.26■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 UFL1O94874 794 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.24■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 FKTNO75072 461 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 TM4SF4P48230 202 aa25.23■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 USP17L8P0C7I0 530 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 SREBF2Q12772 1141 aa25.22■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 GGA1Q9UJY5 639 aa25.21■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 SCN9AQ15858 1988 aa25.2■■□□□ 1.63
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 NF2P35240 595 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF609O15014 1411 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 COL4A1P02462 1669 aa25.2■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.19■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.18■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 RIPK4P57078 832 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.17■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.16■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 USP17L3A6NCW0 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 USP17L4A6NCW7 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 GMLQ99445 158 aa25.15■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM17Q9Y577 477 aa25.14■■□□□ 1.62
SEMA4B-211ENST00000559322 ALDH1A1P00352 501 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.13■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 POTEFA5A3E0 1075 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 PRKG1Q13976 671 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 KRT24Q2M2I5 525 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 PODNQ7Z5L7 613 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 OGFOD1Q8N543 542 aa25.12■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 FBXW7Q969H0 707 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 PSME4Q14997 1843 aa25.09■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 WNT10BO00744 389 aa25.08■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 ATP2B4P23634 1241 aa25.08■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 SPRYD7Q5W111 196 aa25.08■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.08■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 INHBEP58166 350 aa25.06■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.06■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 HYPKQ9NX55 129 aa25.06■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 SASH1O94885 1247 aa25.05■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SEMA4B-211ENST00000559322 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.05■■□□□ 1.6
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