RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM4AO75164 1064 aa23.68■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPM2P07951 284 aa23.68■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRINP3Q76B58 766 aa23.68■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCRN1Q12765 414 aa23.68■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPATA32Q96LK8 384 aa23.68■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 TJP1Q07157 1748 aa23.67■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOSBP53539 338 aa23.67■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.67■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 FGD1P98174 961 aa23.67■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.66■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.66■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.66■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 A0A1B0GUL7 405 aa23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 DACT1Q9NYF0 836 aa23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 ELP1O95163 1332 aa23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 EYA2O00167 538 aa23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 STRN4Q9NRL3 753 aa23.65■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 LAMA4Q16363 1823 aa23.64■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHST3Q7LGC8 479 aa23.64■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.64■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 PALLDQ8WX93 1383 aa23.64■■□□□ 1.38
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.64■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 APOBRQ0VD83 1088 aa23.64■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.64■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 PGBD1Q96JS3 809 aa23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC192P0DO97 292 aa23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 RESTQ13127 1097 aa23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.63■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCT2P78371 535 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP3K11Q16584 847 aa23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAST3O60307 1309 aa23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 H3BQV1 296 aa23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFFO2Q5TF58 517 aa23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.62■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPR108Q9NPR9 543 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 M0R2C6 588 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 NR1I2O75469 434 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTDNEP1O95476 244 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 IL2RBP14784 551 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADORA1P30542 326 aa23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 TYRO3Q06418 890 aa23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNMDQ9H2S6 317 aa23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 E7EWF7 191 aa23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.6■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 LUZP1Q86V48 1076 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 SPC24Q8NBT2 197 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM89AQ96GI7 184 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 PFKFB2O60825 505 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 BICD2Q8TD16 824 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 OSBP2Q969R2 916 aa23.59■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
AFG3L1P-217ENST00000557444 UQCRHLA0A096LP55 91 aa23.58■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 UQCRHP07919 91 aa23.58■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYNE4Q8N205 404 aa23.58■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPDC1A2A3K4 754 aa23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCARF1Q14162 830 aa23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.57■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 GUCY1B3Q02153 619 aa23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANO6Q4KMQ2 910 aa23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 PI16Q6UXB8 463 aa23.56■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRP9O43818 475 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 CIAO1O76071 339 aa23.55■■□□□ 1.36
AFG3L1P-217ENST00000557444 TERF1P54274 439 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 258.5 ms