RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531188.5

RPS3-217, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS3, Length 2,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-217ENST00000531188 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.76□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 ADORA1P30542 326 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 LRP5O75197 1615 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 METTL24Q5JXM2 366 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.75□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 FSD1Q9BTV5 496 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.74□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 RGL2O15211 777 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 PROM2Q8N271 834 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 XAGE2Q96GT9 111 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 FAM227BQ96M60 508 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 HAUS7Q99871 368 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 PALD1Q9ULE6 856 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 RFC4P35249 363 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 SETDB2Q96T68 719 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 A0A1B0GUL6 1792 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 ABCC12Q96J65 1359 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 CHGBP05060 677 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 RXRBP28702 533 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 SNX21Q969T3 373 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 ATP2B3Q16720 1220 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.72□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 A0A0D9SFI3 127 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 TXNRD1Q16881 649 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 HSCBQ8IWL3 235 aa14.71□□□□□ -0.05
RPS3-217ENST00000531188 RTL9Q8NET4 1388 aa14.71□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 MYH7P12883 1935 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 PDE8BO95263 885 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 PTH1RQ03431 593 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 RABEP1Q15276 862 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SNAP23O00161 211 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 GOLIM4O00461 696 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SCARF1Q14162 830 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 GORABQ5T7V8 394 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 RAD50Q92878 1312 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 HIP1O00291 1037 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 TAF5LO75529 589 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SNRKQ9NRH2 765 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 HSPA4P34932 840 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 NFIXQ14938 502 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 POTEAQ6S8J7 498 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 NYXQ9GZU5 481 aa14.69□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 APBA3O96018 575 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 MCCP23508 829 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.68□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 FGFR2P21802 821 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 PI16Q6UXB8 463 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 MED23Q9ULK4 1368 aa14.67□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 GYS1P13807 737 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 RASEFQ8IZ41 740 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.66□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 SSFA2P28290 1259 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 MCAMP43121 646 aa14.65□□□□□ -0.06
RPS3-217ENST00000531188 ZAP70P43403 619 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms