RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSR1P43307 286 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM89AQ96GI7 184 aa19.08■□□□□ 0.64
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NLRP1Q9C000 1473 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF5BP33176 963 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNG11P61952 73 aa19.08■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 N4BP3O15049 544 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBASH3AP57075 661 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTN1Q16799 776 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM266Q2M3C6 531 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JAG2Q9Y219 1238 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP7BP35670 1465 aa19.07■□□□□ 0.64
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEMFO60524 1076 aa19.06■□□□□ 0.64
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