RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 ERLIN2O94905 339 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PAX3P23760 479 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 BAG6P46379 1132 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PLA2G4AP47712 749 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 LMAN1P49257 510 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 IRF5Q13568 498 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 HHATQ5VTY9 493 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CEP135Q66GS9 1140 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MICALL1Q8N3F8 863 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CXorf38Q8TB03 319 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ELP1O95163 1332 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 E9PCH4 1651 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 DDR1Q08345 913 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 DBN1Q16643 649 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 C17orf50Q8WW18 174 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MCM8Q9UJA3 840 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.182e-26■□□□□ 9.2
RABGGTB-208ENST00000471759 SLIT2O94813 1529 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM163BP0C2L3 166 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 STK31Q9BXU1 1019 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MYO6Q9UM54 1294 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ROCK1Q13464 1354 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ECEL1O95672 775 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 OATP04181 439 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 GCKP35557 465 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PEX19P40855 299 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ST5P78524 1137 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TMED1Q13445 227 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 RMDN2Q96LZ7 410 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 IFT57Q9NWB7 429 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PXDNQ92626 1479 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBB4AP04350 444 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PDE3AQ14432 1141 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ELF2Q15723 593 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 RETREG2Q8NC44 543 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 MTA3Q9BTC8 594 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 METP08581 1390 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CHUKO15111 745 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHDP01880 384 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC181Q5TID7 509 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 SAAL1Q96ER3 474 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 AGAP3Q96P47 875 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ORAI2Q96SN7 254 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 USP32Q8NFA0 1604 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 CDR1P51861 262 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 OGFOD1Q8N543 542 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNB2Q92953 911 aa7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms