RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467204.1

HCN3-202, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

TSL 5

Gene HCN3, Length 957 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-202ENST00000467204 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.79□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.79□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.79□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 RIMBP2O15034 1052 aa14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 PDE3AQ14432 1141 aa14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 WASHC4Q2M389 1173 aa14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.78□□□□□ -0.04
HCN3-202ENST00000467204 SHTN1A0MZ66 631 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 C6orf229H3BNL8 230 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 FLIIQ13045 1269 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 IFFO2Q5TF58 517 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 CNTNAP1P78357 1384 aa14.76□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 KIF16BQ96L93 1317 aa14.76□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 CTSWP56202 376 aa14.76□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.76□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 TNIP1Q15025 636 aa14.76□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.76□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 H7C1W4 665 aa14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 PSMD14O00487 310 aa14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 DOK7Q18PE1 504 aa14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 RTL9Q8NET4 1388 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 TRAF5O00463 557 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ECE2O60344 883 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 UFL1O94874 794 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 EYA3Q99504 573 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 GREM2Q9H772 168 aa14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 VEGFBP49765 207 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 CASP7P55210 303 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 GCKRQ14397 625 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 CRBNQ96SW2 442 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 GGA1Q9UJY5 639 aa14.73□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 PCNTO95613 3336 aa14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 RASSF10A6NK89 507 aa14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 MICALL2Q8IY33 904 aa14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.72□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 F6X3S4 739 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 TRIM27P14373 513 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 CST9Q5W186 159 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 LINS1Q8NG48 757 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 PANK1Q8TE04 598 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 DPF2Q92785 391 aa14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HCN3-202ENST00000467204 XDHP47989 1333 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 EGFRP00533 1210 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.7□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 PTPRCP08575 1304 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 H7C1D1 291 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 CSF1RP07333 972 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 ATP2B4P23634 1241 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 FAM161AQ3B820 660 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 BEND3Q5T5X7 828 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 COG6Q9Y2V7 657 aa14.69□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 SCN9AQ15858 1988 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 ITGA6P23229 1130 aa14.68□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HCN3-202ENST00000467204 AAMPQ13685 434 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms