RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436022.2

EFCC1-201, Transcript of EF-hand and coiled-coil domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene EFCC1, Length 2,691 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1-201ENST00000436022 SMC3Q9UQE7 1217 aa26.51■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 SYT1P21579 422 aa26.51■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.51■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.51■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.5■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 RNF20Q5VTR2 975 aa26.5■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 STX6O43752 255 aa26.49■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 GREM2Q9H772 168 aa26.49■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.49■■□□□ 1.83
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EFCC1-201ENST00000436022 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
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EFCC1-201ENST00000436022 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.48■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.48■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 LRP6O75581 1613 aa26.48■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.48■■□□□ 1.83
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EFCC1-201ENST00000436022 RPS6KB1P23443 525 aa26.47■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 PSMA5P28066 241 aa26.47■■□□□ 1.83
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EFCC1-201ENST00000436022 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.47■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 XAGE2Q96GT9 111 aa26.47■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.46■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 GJB2P29033 226 aa26.46■■□□□ 1.83
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EFCC1-201ENST00000436022 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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EFCC1-201ENST00000436022 FIBPO43427 364 aa26.46■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 CYP21A2P08686 494 aa26.46■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 ITGA6P23229 1130 aa26.46■■□□□ 1.83
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EFCC1-201ENST00000436022 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.46■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.46■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 TSPY26PQ9H489 355 aa26.45■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.45■■□□□ 1.83
EFCC1-201ENST00000436022 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.45■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 SH3TC1Q8TE82 1336 aa26.45■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 CDHR2Q9BYE9 1310 aa26.45■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 A0A0G2JLW4 131 aa26.44■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 PI16Q6UXB8 463 aa26.44■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 F13A1P00488 732 aa26.43■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 CTSWP56202 376 aa26.43■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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EFCC1-201ENST00000436022 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.43■■□□□ 1.82
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EFCC1-201ENST00000436022 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.42■■□□□ 1.82
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EFCC1-201ENST00000436022 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.42■■□□□ 1.82
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EFCC1-201ENST00000436022 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 SLIT2O94813 1529 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 FAM177BA6PVY3 158 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 STK3Q13188 491 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 ITPK1Q13572 414 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 METTL24Q5JXM2 366 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 NEK1Q96PY6 1258 aa26.4■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.4■■□□□ 1.82
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EFCC1-201ENST00000436022 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.4■■□□□ 1.82
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EFCC1-201ENST00000436022 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 OSBP2Q969R2 916 aa26.39■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 MTMR6Q9Y217 621 aa26.39■■□□□ 1.82
EFCC1-201ENST00000436022 NRAPQ86VF7 1730 aa26.39■■□□□ 1.81
EFCC1-201ENST00000436022 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.38■■□□□ 1.81
EFCC1-201ENST00000436022 SIK1P57059 783 aa26.38■■□□□ 1.81
EFCC1-201ENST00000436022 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
EFCC1-201ENST00000436022 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
EFCC1-201ENST00000436022 ZAP70P43403 619 aa26.38■■□□□ 1.81
EFCC1-201ENST00000436022 NUP98P52948 1817 aa26.37■■□□□ 1.81
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