RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254661.4

RAMP1-201, Transcript of receptor activity modifying protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAMP1, Length 910 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAMP1-201ENST00000254661 MRS2Q9HD23 443 aa22.03■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.03■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 RNF186Q9NXI6 227 aa22.03■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 TRPA1O75762 1119 aa22.02■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 SOX10P56693 466 aa22.02■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.02■■□□□ 1.12
RAMP1-201ENST00000254661 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.01■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 NEUROD2Q15784 382 aa22■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 CCDC102AQ96A19 550 aa22■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 GGA3Q9NZ52 723 aa22■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 CHL1O00533 1208 aa21.99■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.99■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.99■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 CSRNP1Q96S65 589 aa21.99■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 SCN9AQ15858 1988 aa21.98■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 SLC10A3P09131 477 aa21.98■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 CDCA5Q96FF9 252 aa21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 EYA3Q99504 573 aa21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.97■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 SULF1Q8IWU6 871 aa21.96■■□□□ 1.11
RAMP1-201ENST00000254661 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.95■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 UFL1O94874 794 aa21.93■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 SCARF1Q14162 830 aa21.93■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 MOB2Q70IA6 237 aa21.93■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.93■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.92■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.91■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 G3V3G9 751 aa21.91■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.91■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.91■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.91■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.9■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.9■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 GGA1Q9UJY5 639 aa21.9■■□□□ 1.1
RAMP1-201ENST00000254661 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.89■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 GMLQ99445 158 aa21.89■■□□□ 1.09
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RAMP1-201ENST00000254661 HOXB7P09629 217 aa21.88■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.88■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.87■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.87■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.87■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.87■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 TBC1D8O95759 1140 aa21.86■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 MYD88Q99836 296 aa21.86■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.86■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 USP17L8P0C7I0 530 aa21.85■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 RUNDC1Q96C34 613 aa21.85■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 MXD3Q9BW11 206 aa21.85■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 MBIPQ9NS73 344 aa21.85■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.84■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 ZNF609O15014 1411 aa21.84■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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RAMP1-201ENST00000254661 GOLGA2Q08379 1002 aa21.83■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.83■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.83■■□□□ 1.09
RAMP1-201ENST00000254661 USP17L3A6NCW0 530 aa21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 USP17L4A6NCW7 530 aa21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 PDE8AO60658 829 aa21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.82■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 XDHP47989 1333 aa21.81■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.81■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 PSME4Q14997 1843 aa21.81■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 ATP2B4P23634 1241 aa21.8■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.8■■□□□ 1.08
RAMP1-201ENST00000254661 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.8■■□□□ 1.08
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