RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnf1Q7TSH7 493 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rps6ka5Q8C050 863 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AK157302I3ITR1 129 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21985Q6P6P5 1106 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plcd3Q8K2J0 785 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Isca1Q9D924 129 aa26.61■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Prl3d2F6R3P9 224 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cavin1O54724 392 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kif3aP28741 701 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Lmbrd2Q8C561 694 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abca3Q8R420 1704 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ptgs1P22437 602 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Smc4Q8CG47 1286 aa26.6■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tiam2Q6ZPF3 1715 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cfap58B2RW38 873 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hmx1O70218 332 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 FosbP13346 338 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myd88P22366 296 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nucb2P81117 420 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ints5Q8CHT3 1018 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Inpp5bQ8K337 993 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Krt25Q8VCW2 446 aa26.59■■□□□ 1.85
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hmgn5Q9JL35 406 aa26.59■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa26.58■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gsdma2Q32M21 443 aa26.58■■□□□ 1.85
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa26.58■■□□□ 1.85
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Usp28Q5I043 1051 aa26.57■■□□□ 1.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ehd4Q9EQP2 541 aa26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa26.56■■□□□ 1.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mtmr3Q8K296 1196 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mrc1Q61830 1456 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem266Q8BZB3 538 aa26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pms1Q8K119 917 aa26.55■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tbc1d8Q9Z1A9 1134 aa26.55■■□□□ 1.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam213aQ9CYH2 218 aa26.54■■□□□ 1.84
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ciao1Q99KN2 339 aa26.52■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Fam84aQ9D650 292 aa26.52■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppfia3P60469 1194 aa26.51■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc19Q8CC21 365 aa26.51■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Osbpl5Q9ER64 874 aa26.51■■□□□ 1.84
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Aox4Q3TYQ9 1336 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm973E9Q295 1059 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Slc4a1P04919 929 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem109Q3UBX0 243 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mctp2Q5RJH2 878 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa26.51■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Taok2Q6ZQ29 1240 aa26.51■■□□□ 1.83
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc112A0AUP1 442 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rgs9O54828 675 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TrhQ62361 256 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ncaph2Q8BSP2 607 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem67Q8BR76 992 aa26.5■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
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Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ercc3P49135 783 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hook1Q8BIL5 728 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubxn4Q8VCH8 506 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 TnksQ6PFX9 1320 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spty2d1Q68FG3 682 aa26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nrbp1Q99J45 535 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ubn2Q80WC1 1314 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clec11aO88200 328 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 MsnP26041 577 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cdca8Q8BHX3 289 aa26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Serpina10Q8R121 448 aa26.46■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rapgef3Q8VCC8 918 aa26.46■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tpd52l1O54818 204 aa26.45■■□□□ 1.83
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