RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mb21d2Q8C525 428 aa23.62■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 IncenpQ9WU62 880 aa23.62■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa23.61■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ugt1a5B2RT14 529 aa23.61■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arid3aQ62431 601 aa23.61■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa23.61■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phactr2B1AVP0 632 aa23.6■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 1700029H14RikE9PY36 240 aa23.6■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ube4aE9Q735 1028 aa23.6■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nek11Q8C0Q4 628 aa23.6■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa23.6■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kcnb2A6H8H5 907 aa23.59■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Slurp2P0DP59 97 aa23.59■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 MecomP14404 1042 aa23.59■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nlrp9aQ66X03 949 aa23.59■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam160b2Q80YR2 744 aa23.59■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm4340L7N2C4 268 aa23.59■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Setdb1O88974 1307 aa23.58■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Vwa3bJ9JI28 736 aa23.58■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 RubcnlQ3TD16 648 aa23.58■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sumf1Q8R0F3 372 aa23.58■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tmem143Q8VD26 458 aa23.58■■□□□ 1.37
Msx1-201ENSMUST00000063116 GabrdP22933 449 aa23.57■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 EvcP57680 1005 aa23.57■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map10Q8BJS7 891 aa23.57■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Akt1s1Q9D1F4 257 aa23.57■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myh3P13541 1940 aa23.57■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fbxo41Q6NS60 873 aa23.57■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myh15E9Q264 1925 aa23.56■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Speer4dL7N216 212 aa23.56■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prl3d1P18121 224 aa23.56■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf692Q3U381 531 aa23.56■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccdc7Q9D541 371 aa23.56■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sgsm2Q80U12 1005 aa23.55■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rbm17Q8JZX4 405 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 CpvlQ9D3S9 478 aa23.55■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ube3bQ9ES34 1070 aa23.55■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aknad1E9Q8N6 675 aa23.55■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gjb2Q00977 226 aa23.55■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppp4r3bQ922R5 820 aa23.55■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 EvplQ9D952 2035 aa23.54■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spata31d1bE9QA57 1361 aa23.54■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Edrf1Q6GQV7 1239 aa23.54■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lmbrd2Q8C561 694 aa23.54■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Riok1Q922Q2 567 aa23.54■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Erc1Q99MI1 1120 aa23.54■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kank4Q6P9J5 1016 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 CpzQ8R4V4 654 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdca7lQ922M5 438 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 MeiocA2AG06 965 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eva1cP58659 440 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fam198bQ3UPI1 517 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sp8Q8BMJ8 486 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Emilin1Q99K41 1017 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Chmp4cQ9D7F7 232 aa23.53■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Il17raQ60943 864 aa23.52■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abtb2Q7TQI7 1024 aa23.52■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tti2Q8BGV4 512 aa23.52■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Polr3dQ91WD1 398 aa23.52■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lrrfip2Q91WK0 415 aa23.52■■□□□ 1.36
Msx1-201ENSMUST00000063116 Myh4Q5SX39 1939 aa23.51■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Casq1O09165 405 aa23.51■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kiaa0753Q6A000 959 aa23.51■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 DaxxO35613 739 aa23.51■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf609Q8BZ47 1413 aa23.5■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp44Q8C2S0 711 aa23.5■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 SnrkQ8VDU5 748 aa23.5■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Antxr1Q9CZ52 562 aa23.5■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sept12Q9D451 317 aa23.5■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Osbpl5Q9ER64 874 aa23.5■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Phrf1A6H619 1682 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 IntuQ059U7 942 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atf7Q8R0S1 413 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rufy3Q9D394 469 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm7347D3YYI9 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Speer4aF8VPX6 267 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rps8P62242 208 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rsph3aQ3UFY4 516 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nme8Q715T0 586 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 KinQ8K339 391 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k15A2AQW0 1331 aa23.49■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Celf1P28659 486 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 HlfQ8BW74 295 aa23.48■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adarb2Q9JI20 745 aa23.48■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Heg1E9Q7X6 1337 aa23.48■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cyp2d9P11714 504 aa23.47■■□□□ 1.35
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.5 ms