RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 ACP6Q9NPH0 428 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 EURLQ9NYK6 297 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 KIF25Q9UIL4 384 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 DDX19BQ9UMR2 479 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 NWD1Q149M9 1564 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 MYO5BQ9ULV0 1848 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 SLC22A20A6NK97 555 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 MBTPS2O43462 519 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 NIPSNAP2O75323 286 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 CLIC3O95833 236 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 LALBAP00709 142 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 KLK1P06870 262 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 H2AFZP0C0S5 128 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 LMO2P25791 158 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ADORA2BP29275 332 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 EPHX2P34913 555 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 DEKP35659 375 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 CSKP41240 450 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 GPR1P46091 355 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 SSR4P51571 173 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 MICAQ29983 383 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 PGGHGQ32M88 737 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 SLC35D2Q76EJ3 337 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 LIX1Q8N485 282 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 OR5K2Q8NHB8 316 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 C8orf76Q96K31 380 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 GOLPH3Q9H4A6 298 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 GIN1Q9NXP7 522 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ABCD2Q9UBJ2 740 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ROCK1Q13464 1354 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ZFYVE9O95405 1425 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 IQSEC2Q5JU85 1478 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 LMX1BO60663 402 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SLC19A2O60779 497 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 HSBP1O75506 76 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 EEDO75530 441 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SERPINA5P05154 406 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 KRT16P08779 473 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 IGHV1-2P23083 117 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 IL12BP29460 328 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 AQP2P41181 271 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 UCNP55089 124 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 TLE4Q04727 773 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ZNF33AQ06730 810 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 LTB4RQ15722 352 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ZNF718Q3SXZ3 478 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 UTF1Q5T230 341 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 C9orf66Q5T8R8 295 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SYS1Q8N2H4 156 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 EID2Q8N6I1 236 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 PRELID2Q8N945 189 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 DDI1Q8WTU0 396 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 HRASLS2Q9NWW9 162 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 RSPH14Q9UHP6 348 aa4.77□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 CLTCL1P53675 1640 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 B8ZZF3 427 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 CLDN11O75508 207 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ERLIN2O94905 339 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SMC2O95347 1197 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 TPM3P06753 285 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 LAMP1P11279 417 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 OR1E1P30953 314 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 SLC26A3P40879 764 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 CHRNB3Q05901 458 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 STX3Q13277 289 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 LY6DQ14210 128 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 TRAM2Q15035 370 aa4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
MDM2-201ENST00000258148 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms