RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258148.11

MDM2-201, Transcript of MDM2 proto-oncogene, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MDM2, Length 1,361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2-201ENST00000258148 PID1Q7Z2X4 250 aa4.8□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 SNX20Q7Z614 316 aa4.8□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.8□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.8□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.8□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 GLT1D1Q96MS3 346 aa4.8□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 PPP1R2P9O14990 202 aa4.79□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.79□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 NUBPLQ8TB37 319 aa4.79□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 FGF11Q92914 225 aa4.79□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 STMN2Q93045 179 aa4.79□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 AUP1Q9Y679 476 aa4.79□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 FRMPD3Q5JV73 1810 aa4.79□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 MED14O60244 1454 aa4.79□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 RAB19A4D1S5 217 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 G3V3Y1 287 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 PDHXO00330 501 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 RFXANKO14593 260 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ENTPD5O75356 428 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 BRI3O95415 125 aa4.78□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 THBS3P49746 956 aa4.78□□□□□ -1.64
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MDM2-201ENST00000258148 MEIS3Q99687 375 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 RNF126Q9BV68 326 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 ZYG11BQ9C0D3 744 aa4.78□□□□□ -1.64
MDM2-201ENST00000258148 PIGUQ9H490 435 aa4.78□□□□□ -1.64
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