RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PrndQ9QUG3 179 aa13.65□□□□□ -0.22
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Syt8Q9R0N6 395 aa13.65□□□□□ -0.22
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Skp2Q9Z0Z3 424 aa13.65□□□□□ -0.22
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dcaf4A0A1Y7VNZ0 532 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Agpat1O35083 285 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnj1O88335 372 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnfrsf1bP25119 474 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbx5P70326 518 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Elavl1P70372 326 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fthl17dQ3SXD1 176 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccdc69Q3TCJ8 202 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ptpn21Q62136 1176 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp157Q6PCM4 567 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LcorQ6ZPI3 433 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clrn3Q8BHH8 226 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MaobQ8BW75 520 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Steap2Q8BWB6 489 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nedd4lQ8CFI0 1004 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fthl17Q99MX2 176 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ssr3Q9DCF9 185 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MyotQ9JIF9 496 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il36aQ9JLA2 160 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxo1Q9R1E0 652 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdh11P55288 796 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Elmod1Q3V1U8 326 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxd3Q61060 465 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fzd8Q61091 685 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdh24Q6PFX6 781 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LsampQ8BLK3 341 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc123Q8CII2 336 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il17rcQ8K4C2 698 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr676Q8VGZ9 317 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Paip2bQ91W45 136 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdca4Q9CWM2 237 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slamf9Q9D780 285 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bco1Q9JJS6 566 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Csnk1eQ9JMK2 416 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spint2Q9WU03 252 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1193A2AV13 318 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Skint4A7TZF3 474 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr655E9Q252 308 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20518E9Q548 580 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igfbp3P47878 292 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RoraP51448 523 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Perm1Q149B8 807 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sema3bQ62177 748 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Npr2Q6VVW5 1047 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp954Q7TNU5 416 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc5a7Q8BGY9 580 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem198bQ8CFU0 350 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr215Q8VF82 310 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr164Q8VF87 315 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr99Q8VFE4 305 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr656Q8VGX9 329 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 EsamQ925F2 394 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arfgap1Q9EPJ9 414 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lancl2Q9JJK2 450 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr545Q9WU94 316 aa13.64□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brca2P97929 3329 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prps1l3G3UXL2 318 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn1r120K7N6J6 305 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cnih2O35089 160 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nfatc1O88942 717 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cers1P27545 350 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dcaf7P61963 342 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5113Q3UGK8 141 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Faap20Q3UN58 186 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AasdhQ80WC9 1100 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r3bQ8C767 284 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc31a1Q8K211 196 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rdh10Q8VCH7 341 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Erlec1Q8VEH8 483 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4931417E11RikQ9CR05 305 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtpbp8Q9CY28 285 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdsub1Q9D0I6 474 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prps1Q9D7G0 318 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akap8lQ9R0L7 642 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc7a11Q9WTR6 502 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm21865A0A087WRL2 222 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1315-ps1A0A140LI66 314 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn2r99H3BK37 856 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prl7a1O54830 266 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01661 131 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01662 111 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01663 111 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab2bP59279 216 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rps11P62281 158 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col10a1Q05306 680 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrc28Q3TX51 367 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnfaip3Q60769 775 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vangl1Q80Z96 526 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ssuh2Q8C3L1 340 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Syngr3Q8R191 229 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Olfr1316Q8VG12 314 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Siglec5Q920G3 569 aa13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rrp8Q9DB85 457 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Acox3Q9EPL9 700 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.7 ms