Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N6

Syt8, Synaptotagmin-8, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt8Q9R0N6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Syt8Q9R0N6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Syt8Q9R0N6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Syt8Q9R0N6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Syt8Q9R0N6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Syt8Q9R0N6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Syt8Q9R0N6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Syt8Q9R0N6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syt8Q9R0N6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Syt8Q9R0N6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Syt8Q9R0N6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Syt8Q9R0N6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Syt8Q9R0N6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Syt8Q9R0N6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syt8Q9R0N6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Syt8Q9R0N6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syt8Q9R0N6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syt8Q9R0N6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Syt8Q9R0N6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syt8Q9R0N6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syt8Q9R0N6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syt8Q9R0N6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Syt8Q9R0N6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Syt8Q9R0N6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Syt8Q9R0N6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syt8Q9R0N6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Syt8Q9R0N6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syt8Q9R0N6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Syt8Q9R0N6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Syt8Q9R0N6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Syt8Q9R0N6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Syt8Q9R0N6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Syt8Q9R0N6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Syt8Q9R0N6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Syt8Q9R0N6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syt8Q9R0N6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syt8Q9R0N6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syt8Q9R0N6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syt8Q9R0N6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Syt8Q9R0N6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syt8Q9R0N6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Syt8Q9R0N6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt8Q9R0N6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Syt8Q9R0N6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Syt8Q9R0N6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Syt8Q9R0N6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Syt8Q9R0N6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Syt8Q9R0N6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Syt8Q9R0N6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Syt8Q9R0N6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Syt8Q9R0N6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syt8Q9R0N6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Syt8Q9R0N6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Syt8Q9R0N6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Syt8Q9R0N6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Syt8Q9R0N6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syt8Q9R0N6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syt8Q9R0N6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syt8Q9R0N6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syt8Q9R0N6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Syt8Q9R0N6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Syt8Q9R0N6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Syt8Q9R0N6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syt8Q9R0N6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syt8Q9R0N6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Syt8Q9R0N6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Syt8Q9R0N6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syt8Q9R0N6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syt8Q9R0N6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syt8Q9R0N6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syt8Q9R0N6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syt8Q9R0N6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt8Q9R0N6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syt8Q9R0N6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syt8Q9R0N6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syt8Q9R0N6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syt8Q9R0N6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syt8Q9R0N6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syt8Q9R0N6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syt8Q9R0N6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syt8Q9R0N6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syt8Q9R0N6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syt8Q9R0N6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syt8Q9R0N6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syt8Q9R0N6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syt8Q9R0N6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syt8Q9R0N6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syt8Q9R0N6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syt8Q9R0N6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syt8Q9R0N6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syt8Q9R0N6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syt8Q9R0N6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syt8Q9R0N6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Syt8Q9R0N6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syt8Q9R0N6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syt8Q9R0N6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syt8Q9R0N6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syt8Q9R0N6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syt8Q9R0N6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syt8Q9R0N6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms